SOX17

SOX17
بنى متوفرة بنك بيانات البروتين Ortholog search: PDBe RCSB قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين 2YUL, 4A3N
معرفات
أسماء بديلة	SOX17, VUR3, SRY-box 17, SRY-box transcription factor 17
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 610928 MGI: MGI:107543 HomoloGene: 7948 GeneCards: 64321
علم الوجود الجيني وظائف جزيئية • sequence-specific DNA binding • ربط دي إن إي • beta-catenin binding • ‏GO:0001131، ‏GO:0001151، ‏GO:0001130، ‏GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • ‏GO:0001077، ‏GO:0001212، ‏GO:0001213، ‏GO:0001211، ‏GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • ‏GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • ‏GO:0001200، ‏GO:0001133، ‏GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific مكونات خلوية • transcription regulator complex • بلازم نووي • نواة عمليات حيوية • renal system development • endoderm development • regulation of embryonic development • ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا • ‏GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • stem cell fate specification • positive regulation of skeletal muscle tissue development • embryonic foregut morphogenesis • embryonic organ development • endodermal digestive tract morphogenesis • negative regulation of mesodermal cell fate specification • inner cell mass cellular morphogenesis • negative regulation of Wnt signaling pathway • protein stabilization • endocardium formation • outflow tract morphogenesis • signal transduction involved in regulation of gene expression • endodermal cell fate determination • mRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of mesodermal cell fate specification • ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • بروتين دبيلو.أن.تي • endocardial cell differentiation • regulation of cardiac cell fate specification • نسخ الدنا • stem cell differentiation • embryonic heart tube development • تكون الأوعية • ‏GO:0060469، ‏GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • heart looping • cardiac cell fate determination • common bile duct development • negative regulation of Wnt signaling pathway involved in heart development • rostrocaudal neural tube patterning • ‏GO:1901313 positive regulation of gene expression • cardiogenic plate morphogenesis • heart formation • embryonic heart tube morphogenesis • negative regulation of cell growth • protein destabilization • توليد الأوعية • تكون الحيوانات المنوية • positive regulation of cell differentiation • regulation of stem cell division • تكون المعيدة • gall bladder development • canonical Wnt signaling pathway • regulation of cell differentiation • cell migration involved in gastrulation • endoderm formation • regulation of stem cell proliferation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني • cellular response to leukemia inhibitory factor • تمايز خلوي المصادر:Amigo / QuickGO
تماثلات متسلسلة
أنواع	الإنسان	الفأر
أنتريه	64321	20671
Ensembl	ENSG00000164736	ENSMUSG00000025902
يونيبروت	Q9H6I2	Q61473
RefSeq (رنا مرسال.)	NM_022454	‏NM_001289465، ‏NM_001289466، ‏NM_001289467، ‏NM_011441، ‏XM_030252405، ‏XM_030252410، ‏XM_036162991، ‏XM_036162992 NM_001289464، ‏NM_001289465، ‏NM_001289466، ‏NM_001289467، ‏NM_011441، ‏XM_030252405، ‏XM_030252410، ‏XM_036162991، ‏XM_036162992
RefSeq (بروتين)	NP_071899	‏NP_001276394، ‏NP_001276395، ‏NP_001276396، ‏NP_035571، ‏XP_030108265، ‏XP_030108270، ‏XP_036018884، ‏XP_036018885 NP_001276393، ‏NP_001276394، ‏NP_001276395، ‏NP_001276396، ‏NP_035571، ‏XP_030108265، ‏XP_030108270، ‏XP_036018884، ‏XP_036018885
الموقع (UCSC	n/a	Chr 1: 4.56 – 4.57 Mb
بحث ببمد	[1]	[2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان اعرض/عدّل فأر

SOX17‏ (SRY-box 17) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SOX17 في الإنسان.^[1]

يشفر الجين عضوًا من عائلة عوامل النسخ SOX (صندوق HMG المرتبط بـ SRY)، والذي يقع على الكروموسوم 8 q11.23. جسم الجين معزول داخل نطاق حلقة CTCF. تم تحديد منطقة ميثيلية تفاضلية (ناقصة) خاصة بالأنسجة (DMR) على بعد حوالي 230 كيلو بايت من SOX17، والتي تتكون من عناصر تنظيمية SOX17. تحمل منطقة DMR على وجه الخصوص المعزز النهائي الأبعد الخاص بالأديم الباطن في موضع SOX17. تم تعريف SOX17 نفسه مؤخرًا على أنه ما يسمى بالجين المعزول طوبولوجيًا (TIG). TIGs حسب التعريف هي جينات ترميز بروتين مفرد (PCGs) داخل مجالات حلقة CTCF، والتي يتم إثرائها بشكل أساسي بالمنظمات التنموية ويقترح أن يتم التحكم فيها بإحكام شديد من خلال بنية نطاق الحلقة ثلاثية الأبعاد الخاصة بها.

يشارك SOX17 في تنظيم نمو الأجنة الفقارية وفي تحديد مصير الخلايا الباطنية. يعمل البروتين المشفر في اتجاه مجرى إشارات TGF beta (Activin) وإشارات WNT التقليدية (Wnt3a). وخاصة الفسفرة الصحيحة لـ SMAD2/3 داخل دورة الخلية المعنية (المرحلة G1 المبكرة) أمر بالغ الأهمية لتنشيط الجينات الباطنية الأساسية (على سبيل المثال SOX17) للدخول إلى سلالة الباطنية النهائية. بالإضافة إلى ذلك، يؤدي اضطراب حدود CTCF المركزية لـ SOX17 في التمايز الباطني النهائي المبكر إلى فشل تنموي هائل وما يسمى بحالة الخلية المحاصرة مثل الأديم المتوسط، والتي يمكن إنقاذها من خلال التعبير غير الطبيعي عن SOX17. لقد ثبت في Xenopus gastrulae أن SOX17 يعدل استجابات Wnt، حيث يتم تحديد الخصوصية الجينومية لنسخ Wnt/β-catenin من خلال التفاعلات الوظيفية بين SOX17 ومجمعات النسخ β-catenin/Tcf.