PRCC1

PRCC1
Identifikatori
Aliasi
Vanjski ID-jevi	GeneCards: [1]
Ortolozi
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n; a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Prolinski bogata upredena zavojnica-1 (PRCC1) jest uobičajeni je naziv proteina zvanog CAD38605 koji je kod ljudi kodiran genom PRCC1 sa hromosoma 5 . Kodira polipeptid sa 445 aminokiselina za predviđenih ukupno šest egzona. Predviđena molekulska težina je 46,7 kDa, a izoelektrična tačka je 5,46.^[1] Ortolozi utvrđeni su u većini eukariota, od kojih je većina konzervirana kod većine vrsta sisara. Umjerena konzerviranost se održava među ostalim udaljenim vrstama kao što su: Gallus gallus, Xenopus, Strongylocentrotus purpuratus, Tetraodon itd.

Gen PRCC1 ima dvije različite regije: prolin-bogatu regiju na N-terminalu i regiju domena nepoznate funkcije 84 (DUF84) na C-terminalu.

Regija DUF84 nalazi se i u genomu bakterije zvane Vibrio cholerae.^[2] Regija se sastoji od približno 183 aminokiselinska ostatka. V. cholorae uzrokuje koleru i želučanu gripu kod ljudi. Samo područje DUF84 ima oko 160 aminokiselinskih ostataka. To je jedini protein koji se sastoji od DUF84 osim PRCC1.

Program predviđanja subćelijske lokalizacije pTarget predviđa da se PRCC1 nalazi u jedru s pouzdanjem od 95%.^[3] Međutim, istraživački rad Kamakarija et al. odredio da se protein lokalizira u Golgijevom aparatu.^[4] PRCC1 je sveprisutno eksprimiran, s ekspresijom visoke gustoće u mozgu, hipotalamusu i hipokampusu. Nisu pronađeni dokazi o interakciji protein-protein. Nisu utvrđeni dokazi o alternativnoj prerad RNK.

Reference

^ Kagachi, Chihiro (2007). "A Comparison of Bacterial Genomes". Seikagaku- the Journal of Japanese Biochemical Society.
^ "NTPase [Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961]". National Center for Biotechnology Information.
^ pTarget Arhivirano 27. 6. 2009. na Wayback Machine.
^ Kamakari S, Roussou A, Jefferson A, Ragoussis I, Anagnou NP (januar 2005). "Structural analysis and expression profile of a novel gene on chromosome 5q23 encoding a Golgi-associated protein with six splice variants, and involved within the 5q deletion of a Ph(-) CML patient". Leukemia Research. 29 (1): 17–31. doi:10.1016/j.leukres.2004.04.019. PMID 15541471.

Vanjski linkovi

[1] Kagachi, Chihiro (2007). "A Comparison of Bacterial Genomes". Seikagaku- the Journal of Japanese Biochemical Society.

[2] "NTPase [Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961]". National Center for Biotechnology Information.

[3] Target Arhivirano 27. 6. 2009. na Wayback Machine.

[paper-4] Kamakari S, Roussou A, Jefferson A, Ragoussis I, Anagnou NP (januar 2005). "Structural analysis and expression profile of a novel gene on chromosome 5q23 encoding a Golgi-associated protein with six splice variants, and involved within the 5q deletion of a Ph(-) CML patient". Leukemia Research. 29 (1): 17–31. doi:10.1016/j.leukres.2004.04.019. PMID 15541471.

[1]

[2]

[3]

[4]