Suba ang Emajõgi sa Estoniya.[1] Nahimutang ni sa sidlakang bahin sa nasod, 180 km sa habagatan-sidlakan sa Tallinn ang ulohan sa nasod. Emajõgi nga nahimutang sa lanaw sa Lake Peipus. Ang Emajõgi mao ang bahin sa tubig-saluran sa Narva, ug usa ka sanga sa Velikaya.