A principios de 2019, disputó con la selección catarí la Copa Asiática, consiguiendo proclamarse campeones por primera vez en su historia tras vencer en la final a Japón por 3 a 1.[3] Durante la competición, ganaron todos los partidos disputados, con un balance de diecinueve goles a favor y uno en contra.[4] En mayo de ese año, firmó un nuevo contrato hasta la finalización del Mundial 2022, que fue organizada por Catar.[5] Semanas después, el equipo fue invitado a la Copa América 2019 en Brasil, quedando eliminado en la fase de grupos.[6] En diciembre, en la Copa de Naciones del Golfo, el equipo alcanzó las semifinales.[7]
En la Copa Mundial de la FIFA 2022, la selección nacional perdió todos sus partidos en el grupo A, para convertirse en la nación anfitriona con peor desempeño en la historia de la competencia. El 30 de diciembre de 2022, la Asociación de Fútbol de Catar informó que no renovaría el contrato del técnico español, poniendo fin a 5 años de relación.[10]
El 11 de marzo de 2023, fue oficializado como nuevo entrenador de la selección de Ecuador.[11]El 5 de julio de 2024, fue relevado de sus funciones luego de la eliminación en la Copa América 2024.[12]
En julio de 2024, asumió al frente del Al-Sadd catarí y firmó un contrato por dos temporadas.[13]
Participaciones en campeonatos juveniles de la AFC