الگو:Infobox biodatabase
جعبه اطلاعات مورد استفاده برای توصیف یک پایگاه داده زیستی. برای هر پایگاه دادهای که میخواهیم بشناسیم، در صورتی که این پایگاه داده همچنان مورد استفاده باشد، و اگر خدمت وب یا دسترسی اسکیوال ممکن باشد، اگر این پایگاه داده ویژه یک جاندار مشخص باشد و غیره.
لطفاً فراموش نکنید که رده:پایگاه دادههای زیستشناسی را در پایین مقاله بیفزایید.
استفاده
{logo} | |
---|---|
محتوا | |
توضیح | {description} |
گونههای دادههای گرفتهشده | {scope} |
ارگانیسمها | {organism} |
تماس | |
مرکز پژوهش | {center} |
آزمایشگاه | {laboratory} |
پدیدآوران | {author} |
استناد ابتدایی | {citation} |
تاریخ انتشار | {released} |
دسترسی | |
استانداردها | {standard} |
قالب دادهها | {format} |
وبگاه | {url} |
نشانی اینترنتی دریافت | {download} |
نشانی اینترنتی خدمات وب | {webservice} |
دسترسی همگانی اسکیوال | {sql} |
نقطهٔ پایانی اسپارکل | {sparql} |
ابزارها | |
وب | {webapp} |
مستقل | {standalone} |
گوناگون | |
پروانه | {license} |
نسخهبندی | {versioning} |
تناوب انتشار دادهها | {frequency} |
نسخه | {version} |
سیاست گزینش | {curation} |
نهادهای قابل بوکمارک | {bookmark} |
فیلدها
محتوا
- title: عنوان؛ مانند: پایگاه اطلاعات فیوزاریم
- description: توضیحاتویژهمانند: زیرساختهای سایبری برای فیوزاریم
- scope: میتواند یکی از این موارد باشد: Nucleotide Sequence, RNA sequence, Protein sequence, Structure, Genomics (non-vertebrate), Metabolic and Signaling Pathways, Human and other Vertebrate Genomes, Human Genes and Diseases, Microarray Data and other Gene Expression, Proteomics Resources, Other Molecular Biology, Organelle, Plant, Immunological...
- organism: یک یا چند جاندار ویژه این پایگاه داده
تماس
- center یا centre: مرکز پژوهشی. مانند: مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری
- laboratory: آزمایشگاه
- author: مؤلفین پایگاه داده
- citation: ارجاع اولیه به مقالهای که پایگاه داده را توصیف میکند (برای شناسه پابمد از
pmid=
بهطور جایگزین استفاده کنید، اما از هر دو پارامتر بهصورت همزمان استفاده نکنید.) - pmid: شناسه پابمد برای مقالهای که پایگاه داده را توصیف میکند (میتوانید از
citation=
بهعنوان جایگزین استفاده کنید، اما از هر دو پارامتر بهصورت همزمان استفاده نکنید.) - released: تاریخ انتشار
دسترسی
- standard: MIs، فرمتهای دادهها، اصطلاحشناسی
- format: فرمتهای دادهها
- sql: در صورتی که پایگاه داده بهصورت یک سرور اسکیوال عمومی در دسترس باشد (میتواند یک نشانی اینترنتی به مقصد خود سند باشد)
- webservice: اگر یک خدمت وب برای این پایگاه داده وجود دارد (میتواند یک نشانی اینترنتی به مقصد یک پروندهٔ ویزدل باشد.
- sparql: نقطه(های) پایان اسپارکل در صورت وجود
- download: فضای دریافت، وبگاه افتیپی و ...
ابزارها
- webapp: برنامه(های) کاربردی وب
- standalone: ابزار(های) مستقل
گوناگون
- versioning: سیاست نسخهبندی / دسترسی به پروندههای تاریخی
- license: مجوز یک داده
- frequency: بسامد انتشار داده
- curation: سیاست گزینش
- version: نسخه منتشرشده
- bookmark: قابلیت بوکمارک کردن موجودیت در این پایگاه داده (شیوه GET اچتیتیپی)
انگلیسی
میتوانید از روی نسخه انگلیسی کپی کنید یا به صورت دستی زیر، وارد کنید:
{Infobox biodatabase |title = |logo = |description = |scope = |organism = |center = |laboratory = |author = |citation = |released = |standard = |format = |url = |download = |webservice = |sql = |sparql = |webapp = |standalone = |license = |versioning = |frequency = |curation = |bookmark = |version = }
نمونه
محتوا | |
---|---|
توضیح | ژنپایگاه، پایگاه اطلاعات توالی ژنتیک انآیاچ |
گونههای دادههای گرفتهشده | توالی نوکلئوتید، توالی پروتئین |
ارگانیسمها | همه |
تماس | |
مرکز پژوهش | مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری |
استناد ابتدایی | PMID 21071399 |
دسترسی | |
قالب دادهها | اکسامال ایاسان.۱ فرمت ژنپایگاه |
وبگاه | NCBI |
نشانی اینترنتی دریافت | ncbi ftp |
نشانی اینترنتی خدمات وب | eutils soap |
ابزارها | |
وب | بلاست |
مستقل | بلاست |
گوناگون | |
پروانه | دامنه عمومی-دولت ایالات متحده |
نهادهای قابل بوکمارک | yes |
{Infobox biodatabase
| title = [[ژنپایگاه]]
| author =
| center = [[مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری]]
| organism = همه
| description = ژنپایگاه، پایگاه اطلاعات توالی ژنتیک انآیاچ
| scope = توالی نوکلئوتید، توالی پروتئین
| url = [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ NCBI]
| download = [ftp://ftp.ncbi.nih.gov/ ncbi ftp]
| webservice = [http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/ eutils]<br/>[http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/eutils.wsdl soap]
| license = دامنه عمومی-دولت ایالات متحده
| pmid = 21071399
| logo = [[پرونده:US-NLM-NCBI-Logo.svg|60px]]
| standalone=[[بلاست]]
| webapp=[[بلاست]]
| format= [[اکسامال]]<br/>[[ایاسان.۱]]<br/>فرمت ژنپایگاه
| bookmark= yes
}
ساخت سریع با اکساسالتی
برگه سبک نگارش اکساسالتی زیر https://gist.github.com/768553 میتواند برای ساخت یک صفحهٔ خرد از یک مقالهٔ پابمد استفاده شود.
نمونه با اکساسالپروک
$ xsltproc --novalid \
> pubmed4biodb.xsl \
> "http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=pubmed&id=19846593&retmode=xml"
{infobox_biodatabase
|title = REBASE--a database for DNA restriction and modification: enzymes, genes and genomes.
|logo =[[File:Database.png]]
|description = REBASE--a database for DNA restriction and modification: enzymes, genes and genomes.
|scope =
|organism =
|center =
|laboratory = New England Biolabs, Inc, 240 County Road, Ipswich, MA 01938, USA.
|author = Richard J Roberts
|pmid = 19846593
(...)
ردههای ردیابی
- رده:صفحههایی که از infobox biodatabase با شناسه پابمد ناقص استفاده میکنند (۰)
- رده:صفحههایی که از جعبه اطلاعات Infobox biodatabase با پارامترهای نامعلوم استفاده میکنند (۱)