Euamoebida

Euamoebida
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Amorphea
Csoport: Amoebozoa
Csoport: Tubulinea
Csoport: Elardia
Csoport: Euamoebida
Lepși 1960 emend. Smirnov et al. 2011[1]
Kládok[2]
Hivatkozások
Wikifajok
Wikifajok

A Wikifajok tartalmaz Euamoebida témájú rendszertani információt.

Az Euamoebida a Tubulinea Elardia ribocsoportjának kládja az Amoebozoa csoportban.[1]

Történet

Lepși 1960-ban írta le a csoportot. Később több meghatározása is megjelent, legutóbb 2011-ben.[1]

Sawyer és Griffin 1975-ben hozták létre az Acanthamoebidae csoportot, melyet Page Acanthopodina néven az Amoebida alrendjeként sorolt be, de a Hartmannella nemzetséget a Hartmannellidae csoportba helyezte az Euamoebidán belül, elkülönítve az Acanthopodidától, melynek az Acanthamoebidae része volt.[3]

Thomas Cavalier-Smith 1993-as rendszertanában a Dictyozoa alország Neozoa alországága Neosarcodina részalországa Rhizopoda törzse Lobosea osztálya Gymnamoebia alosztályába sorolta rendként.[4]:970 2003-ban parafiletikus csoportként írta le, mely közös kládon van a Dictyostelia csoporttal, mely nem tartozik oda.[5] Smirnov et al. 2011-ben a Lobosa altörzs Tubulinea osztályába sorolták az 5 rend egyikeként, és meghatározását kiegészítették.[6]

2019-ben Adl et al. 15 nemzetséget soroltak ide,[1] 2022-ben Tekle et al. pedig kimutatták, hogy a Nolandella bazálisabb az Amoeba proteus és a Copromyxa protea fajoknál, önálló ágat alkotva.[7]

Morfológia

Fajai héj nélküli amőbák, melyek állábai vagy – monopodiális sejtek esetén – teljes sejtteste csőszerű és hengerszerű. Rögzítő farokszerű szerkezete nincs.[1]

Élőhely

Világszerte előfordulnak fajai.[8] Az Euamoebida gyakoribb oxigéntartalmú, mint oxigénmentes környezetekben,[9] és gyakori többek közt gyepek és erdők talajképző rétegében.[10]

Egyes fajai termofilek.[11]

Életmód

Az Amoeba, a Cashia, a Chaos, a Polychaos, a Trichamoeba és a Deutermoeba eukariótákat esznek, közülük a Polychaos például kovamoszatokat eszik. Legtöbb faja azonban baktériumokat eszik.[1]

Életciklus

Mozgó állapota nem váltakozik, egyes fajai szorokarpikusan fejlődnek,[1] és vannak a Protostelialeshez hasonló termőtestei.[12] Egyes fajai – például a Sappinia nemzetségben – kétmagvúak, vagy rendelkeznek álló állapottal.[12]

Haplodiploid életciklusában gyakori az aneuploiditás, például az Amoeba proteus és az Amoeba borokensis mitózisa profázisában is előfordul, és az ivarosság alternatívája lehet a genetikai rekombinációhoz az ivartalan egysejtűekben. Ivaros szaporodása nem ismert.[13] Megtalálható külön trofozoita- és cisztaállapot, ez Viszveszvara és Balamuth 1975-ös tanulmánya alapján jelentősen különbözik.[9]

Ökológia

Életciklusa során számos vírus és endoszimbionta baktérium található benne, a Sappinia nemzetség endoszimbionta gombákkal is rendelkezik.[12] Csak 2008-ban kezdődött a velük való kapcsolatok és lehetséges genetikai rekombináció tanulmányozása például két amőbafertőző óriásvírus (a mimivírus és marseillevírus) esetén.[14]

A Rozellomycota és Zoopagomycota egyes endoparazita gombáira érzékenyek fajai.[15]

Genetika

Az Amoeba nemzetség egyes fajait a legnagyobb genomokkal rendelkezőknek tekintették – például Friz 1968-ban az Amoeba dubia genomját mintegy 600 Gbp hosszúnak becsülte; de ennek helyessége vitatott, mert a becslés a fejlett genomika kialakulása előtt történt, így kizárólag kvalitatív adatokon alapul, és nem megerősített, például mert számos Amoebozoa-faj életciklusa poliploid állapottal rendelkezik.[16]

Bár nem igazolták ivaros szaporodását, az Euamoebida több fajánál megfigyeltek meiózist, genomduplikációt és a rekombinációt lehetővé tehető aneuploiditást[16] és poliploiditást,[17] továbbá genomjában jelen vannak meiózisra utaló gének is.

Jelentőség

A Sappinia pedata humán opportunista patogén lehet, mely vízben, marha-, vapiti- vagy bölényürülékkel szennyezett talajban és levegőben él, és granulómamentes amőbás encephalitist okozhat.[18] 2024-ig egyetlen Sappinia okozta humán encephalitises esetet írtak le. Ez még 2001-ben történt egy 38 éves immunhiánymentes betegben, aki neurológiai következmények nélkül gyógyult Balamuthia elleni antimikrobiális gyógyszerek hatására, és eredetileg Sappinia diploideaként írták le morfológiai elemzés alapján, de molekuláris elemzések igazolták, hogy a S. pedatához tartozik.[12]

Jegyzetek

  1. ↑ a b c d e f g Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, Del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019. január 19.). „Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes”. J Eukaryot Microbiol 66 (1), 4–119. o. DOI:10.1111/jeu.12691. PMID 30257078. PMC 6492006. 
  2. ↑ Euamoebida. NCBI Taxonomy Browser . NCBI. (Hozzáférés: 2024. november 24.)
  3. ↑ Im KI, Shin HJ (2003. december 20.). „Acanthamoeba sohi, n. sp., a pathogenic Korean isolate YM-4 from a freshwater fish”. Korean J Parasitol 41 (4), 181–188. o. DOI:10.3347/kjp.2003.41.4.181. PMID 14699258. PMC 2717509. 
  4. ↑ Cavalier-Smith T (1993. december). „Kingdom Protozoa and its 18 phyla”. Microbiol Rev 57 (4), 953–994. o. DOI:10.1128/mr.57.4.953-994.1993. PMID 8302218. PMC 372943. 
  5. ↑ Cavalier-Smith T (2004. június 22.). „Only six kingdoms of life”. Proc Biol Sci 271 (1545), 1251–1262. o. DOI:10.1098/rspb.2004.2705. PMID 15306349. PMC 1691724. 
  6. ↑ Smirnov AV, Chao E, Nassonova ES, Cavalier-Smith T (2011. július 28.). „A revised classification of naked lobose amoebae (Amoebozoa: lobosa)”. Protist 162 (4), 545–570. o. DOI:10.1016/j.protis.2011.04.004. PMID 21798804. 
  7. ↑ Tekle YI, Wang F, Wood FC, Anderson OR, Smirnov A (2022. július 1.). „New insights on the evolutionary relationships between the major lineages of Amoebozoa”. Sci Rep 12. DOI:10.1038/s41598-022-15372-7. PMID 35778543. PMC 9249873. 
  8. ↑ Mathison BA, Sapp SGH (2021. november 9.). „An annotated checklist of the eukaryotic parasites of humans, exclusive of fungi and algae”. Zookeys 1069, 1–313. o. DOI:10.3897/zookeys.1069.67403. PMID 34819766. PMC 8595220. 
  9. ↑ a b Chatzinotas A, Schellenberger S, Glaser K, Kolb S. Assimilation of cellulose-derived carbon by microeukaryotes in oxic and anoxic slurries of an aerated soil (2013. július 12.). „{title}”. Appl Environ Microbiol 79 (18), 5777–5781. o. DOI:10.1128/AEM.01598-13. PMID 23851095. PMC 3754146. 
  10. ↑ Harkes P, Suleiman AKA, van den Elsen SJJ, de Haan JJ, Holterman M, Kuramae EE, Helder J (2019. szeptember 18.). „Conventional and organic soil management as divergent drivers of resident and active fractions of major soil food web constituents”. Sci Rep 9. DOI:10.1038/s41598-019-49854-y. PMID 31534146. PMC 6751164. 
  11. ↑ Liew KJ, Liang CH, Lau YT, Yaakop AS, Chan KG, Shahar S, Shamsir MS, Goh KM (2022. február 18.). „Thermophiles and carbohydrate-active enzymes (CAZymes) in biofilm microbial consortia that decompose lignocellulosic plant litters at high temperatures”. Sci Rep 12. DOI:10.1038/s41598-022-06943-9. PMID 35181739. PMC 8857248. 
  12. ↑ a b c d Siddiqui R, Makhlouf Z, Maciver SK, Alharbi AM, Khan NA (2024. június). „Sappinia spp.: An update”. Microbe 3. DOI:10.1016/j.microb.2024.100095. ISSN 2950-1946. (Hozzáférés: 2024. november 24.) 
  13. ↑ Demin SY, Podlipaeva YI, Berdleva MA, Goodkov AV. „The karyotype of Amoeba borokensis from a “proteus-like” amoeba group (Amoebozoa: Euamoebida)”. Cell Tissue Biol 12 (1), 85–91. o. (Hozzáférés: 2024. november 24.) , eredeti: Demin SY, Podlipaeva YI, Berdleva MA, Goodkov AV. „Кариотип Amoeba borokensis из группы близкородственных видов « proteus-подобных » амеб (Amoebozoa: Euamoebida)” (orosz nyelven). Citologiâ 59 (10), 718–723. o. (Hozzáférés: 2024. november 24.) 
  14. ↑ Lahr DJ, Parfrey LW, Mitchell EA, Katz LA, Lara E (2011. július 22.). „The chastity of amoebae: re-evaluating evidence for sex in amoeboid organisms”. Proc Biol Sci 278 (1715), 2081–90. o. DOI:10.1098/rspb.2011.0289. PMID 21429931. PMC 3107637. 
  15. ↑ Michel R, Walochnik J, Scheid P (2014. október 13.). „Article for the "Free-living amoebae special issue": Isolation and characterisation of various amoebophagous fungi and evaluation of their prey spectrum”. Exp Parasitol 145 Suppl, S131–S136. o. DOI:10.1016/j.exppara.2014.10.005. PMID 25311445. 
  16. ↑ a b Tekle YI, Tefera H (2024. március 2.). „A small genome amidst the giants: Evidence of genome reduction in a small tubulinid free-living amoeba”. Genome Biol Evol 16 (3). DOI:10.1093/gbe/evae058. PMID 38504610. PMC 10980511. 
  17. ↑ Maciver SK (2016. szeptember 3.). „Asexual Amoebae Escape Muller's Ratchet through Polyploidy”. Trends Parasitol 32 (11), 855–862. o. DOI:10.1016/j.pt.2016.08.006. PMID 27599632. 
  18. ↑ Visvesvara GS, Moura H, Schuster FL (2007. április 11.). „Pathogenic and opportunistic free-living amoebae: Acanthamoeba spp., Balamuthia mandrillaris, Naegleria fowleri, and Sappinia diploidea”. FEMS Immunol Med Microbiol 50 (1), 1–26. o. DOI:10.1111/j.1574-695X.2007.00232.x. PMID 17428307. (Hozzáférés: 2024. november 24.) 

További információk