Dopo non essere stato scelto nel Draft NFL 2003, Moorehead firmò con gli Indianapolis Colts. In cinque anni di carriera tutti coi Colts, ricevette 31 passaggi per 330 yard e un touchdown. Diede tuttavia il suo contributo nei playoff del 2006 culminati nella vittoria del Super Bowl XLI[1] quando ricevette complessivamente 5 passaggi per 41 yard. Aaron e suo padre Emery sono stati la prima coppia di padre e figlio prima a raggiungere e poi a vincere entrambi il Super Bowl.
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