Il doppio dell'Almaty Cup 2009 è stato un torneo di tennis facente parte dell'ATP Challenger Tour 2009.
Alexandre Krasnoroutsky e Denys Molčanov erano i detentori del titolo, ma solo Molchanov ha partecipato in coppia con Yang Tsung-hua e ha battuto in finale Pierre-Ludovic Duclos e Aleksej Kedrjuk 4–6, 7–6(5), [11–9].