La Coppa delle nazioni UNCAF 1999(UNCAF Nations Cup 1999) fu la quinta edizione della Coppa delle nazioni UNCAF, la competizione calcistica per nazione organizzata dall'UNCAF. La competizione si svolse in Costa Rica dal 17 marzo al 28 marzo 1999 e vide la partecipazione di sei squadre: Belize, Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras e Nicaragua. Il torneo, che si tiene ogni due anni a partire dal 1991, vale anche come qualificazione per la CONCACAF Gold Cup.
L'UNCAF organizzò questa competizione dal 1991 al 2009 sotto il nome di Coppa delle nazioni UNCAF; dall'edizione del 2011 cambiò nome e divenne Coppa centroamericana.
Formula
Fase a gruppi - 6 squadre, divisi in due gruppi da tre squadre. Giocano partite di sola andata, la prima e la seconda classificata si qualificano al girone finale.
Girone finale - 4 squadre, giocano partite di sola andata. La vincente si laurea campione UNCAF. Le prime tre classificate si qualificano alla fase finale della CONCACAF Gold Cup 2000. La quarta classificata accede agli spareggi per la CONCACAF Gold Cup 2000.
Nella sezione "partecipazioni precedenti al torneo", le date in grassetto indicano che la nazione ha vinto quella edizione del torneo, mentre le date in corsivo indicano la nazione ospitante.