Il Giro di Romandia 1999, cinquantatreesima edizione della corsa, si svolse dal 4 al 9 maggio su un percorso di 764 km ripartiti in 6 tappe e un cronoprologo, con partenza a Bernex e arrivo a Ginevra. Fu vinto dal francese Laurent Jalabert della ONCE-Deutsche Bank davanti allo svizzero Beat Zberg e all'italiano Wladimir Belli.