Il Giro dei Paesi Bassi 1999, trentanovesima edizione della corsa, si svolse dal 24 al 28 agosto 1999 su un percorso di 889 km ripartiti in 5 tappe (la terza suddivisa in due semitappe), con partenza da Gouda e arrivo a Landgraaf. Fu vinto dall'ucraino Serhij Honcar della squadra Vini Caldirola-Sidermec davanti all'olandese Erik Dekker e allo statunitense Dylan Casey.