La Pokal Nogometne zveze Slovenije 2006./07. (in lingua italiana: Coppa della federazione calcistica slovena 2006-07), detta anche Pokal Hervis 2006./07. per motivi di sponsorizzazione,[1] fu la sedicesima edizione della coppa nazionale di calcio della Repubblica di Slovenia.
A vincere fu il Koper, al suo secondo titolo nella competizione.[2]
Questo successo diede ai giallo-blu l'accesso alla Coppa UEFA 2007-2008.
Le 10 squadre della 1. SNL 2006-2007, più il Rudar Velenje (10° in 1. SNL 2005-2006), sono ammesse di diritto. Gli altri 20 posti sono stati assegnati attraverso le coppe inter–comunali.