Anadirā ir bargs jūras klimats, janvāra vidējā temperatūra ir -20 °C, bet jūlija 9—10 °C. Nokrišņu daudzums ir 500 mm gadā, galvenokārt vasarā. Pateicoties jūras tuvumam, ziemas Anadirā ir siltākas, bet vasaras vēsākas, nekā Čukotkas kontinentālajos rajonos. Gada vidējā gaisa temperatūra Anadirā ir -7,6 °C, vēja ātrums 6,4 m/s un gaisa mitrums ir 82%.