Het programma van de voorronde,eerste en tweede ronde werd bekendgemaakt op 9 december2011[3] .De kwalificatiewedstrijden worden over twee wedstrijden gespeeld waarbij de Uitdoelpuntenregel van toepassing is als beide teams na twee wedstrijden gelijkstaan volgen er direct Strafschoppen (er wordt niet 2x verlengd) .[4]
De acht winnaars van de tweede ronde speelden tegen de acht verliezers van de tweede ronde van de CAF Champions League. De winnaars plaatsten zich voor de groepsfase. De loting voor deze ronde en de groepsfase vond plaats op 15 mei2012[5]