O torneio de futebol nos Jogos da Lusofonia de 2006 ocorreu no Campo Desportivo e Pavilhão da U.C.T.M. e no Estádio Campo Desportivo entre 4 e 10 de outubro. A seleção favorita, de Portugal, venceu o torneio, derrotando Angola na final. A maior ausência foi da seleção brasileira, que decidiu não participar da disputa.