V srednjem veku so barje (nizozemsko: veen) izsušili. Območje so uporabili za kmetijstvo, kasneje pa so kopali šoto, ki so jo uporabljali kot gorivo. Zaradi tega je v začetku 13. stoletja na tem območju barja zahodno od Ouderkerka nastala barjanska naselbina Amstelveen.
Z izgradnjo jezu v 13. stoletju v izlivu reke v severnem delu Nieuwer-Amstel je nastala ribiška vas Amstelerdam, ki je bila prvič omenjena 27. oktobra 1275 in je dobila mestne pravice v začetku 14. stoletja. Zaradi ugodne lege na Zuiderzeeju, povezanosti z Nemčijo in naprej v Skandinavijo ter zaradi rečne povezave z Dordrechtom in Antwerpnom se je naselje razvilo v manjše mesto.
Prvotno se je Amstel izlival v IJ mimo Rokina in Damraka. Danes je estuarij v središču mesta na Muntpleinu. Zadnji del ulice ob reki Amstel se imenuje tudi Amstel. Amstel zdaj teče v IJ po cevovodih pod zasutimi deli Rokina in Damraka, vendar se večina vode odvaja po kanalskem sistemu.
V 17. in 18. stoletju so ob Amstelu zgradili številne domove premožnih meščanov, vendar jih je večina propadla. Hiši Oostermeer in Westeramstel še vedno stojita na nasipu Amstel.
