Poksvirus

Poxviridae
Klasifikacija virusov Uredi to klasifikacijo
(nerangirano): Virus
Realm: Varidnaviria
Kraljestvo: Bamfordvirae
Deblo: Nucleocytoviricota
Razred: Pokkesviricetes
Red: Chitovirales (poksvirus)
Družina: Poxviridae
Poddružine

Glej besedilo

Poksvirusi (znanstveno ime Poxviridae so družina velikih kompleksnih virusov z dvoverižno DNK in večslojnimi ovojnicami, ki imajo afiniteto do kože in so patogeni za človeka in živali (za človeka so pomembni rodovi Orthopoxvirus, Parapoxvirus, Molluscipoxvirus in Yatapoxvirus).[1][2] So opekaste ali jajčaste oblike. Vsi predstavniki imajo skupen nukleoproteinski antigen; razmnožujejo se v citoplazmi gostiteljske celice. So povzročitelji koz pri človeku (virus črnih koz) in živalih (govedo, koze, prašiči, perutnina, kunci, zajci).[3] Nekateri predstavniki so patogeni za človeka in živali (virus govejih koz). Med poksviruse spada tudi virus vakcinije, ki so ga uporabljali za cepljenje proti črnim kozam.[4]

Pri človeku lahko povzročijo bolezen štirje rodovi: ortopoksvirusi, parapoksvirusi, jatapoksvirusi in moluskipoksvirusi:
ortopoksvirusi: virus črnih koz (virus variole), virus vakcinije, virus kravjih koz, virus opičjih koz;
parapoksvirusi: virus orfa, virus psevdokravjih koz, virus govejega papularnega stomatitisa;
jatapoksvirusi: tanapoksvirus, tumorski virus opic jaba;
moluskipoksvirusi: virus mehkužk (virus molluscum contagiosum).[5]

Zgradba

A. Posnetek poksvirusnega delca pod elektronskim mikroskopom. B) Posnetek negativno obarvanega poksvirusnega delca v celični kulturi.

Poksvirusni virioni imajo praviloma zunanjo virusno ovojnico, vendar so kužni tudi znotrajcelični zreli virioni, ki vsebujejo drugačno obliko ovojnice. Vrste se med seboj razlikujejo po obliki, vendar so nasplošno opekaste ali jajčaste oblike. Poksivirusi so nenavadno veliki in merijo okoli 200 nm v premer in 300 nm v dolžino. Virusna dednina je v obliki enojnega, linearnega dvoverižnega odseka DNK.[6] Rinovirusi, ki povzročajo prehlad, so na primer desetkrat manjši od tipičnega poksvirusa.[7]

Podvojevanje

Podvojevanje poksvirusov se začne v citoplazmi, kar sicer ni značilno za viruse z dvoverižno DNK (dsDNA),[8] je pa značilno tudi za druge velike viruse.[9] Poksvirusi nosijo sami zapis za ustroj, potreben za prepis genoma, in sicer zapis za encim od DNK odvisno RNK-polimerazo.[10] Le-ta omogoči prepisovanje virusne DNK v gostiteljevi citoplazmi. Sicer večina drugih dsDNA-virusov potrebuje gostiteljevo od DNK odvisno RNK-polimerazo, ta pa se nahaja v celičnem jedru gostiteljeve celice. Zato se cikel podvojevanja drugih dsDNA-virusov dogodi v samem jedru.

Taksonomija

Vrste v poddružini Chordopoxvirinae lahko okužijo vretenčarje, medtem ko vrste v poddružini Entomopoxvirinae lahko okužijo žuželke. V poddružini Chordopoxvirinae je trenutno priznanih deset rodov, v poddružini Entomopoxvirinae pa trije.

Priznane so naslednje poddružine in rodovi (-virinae označuje poddružino in -virus označuje rod):[3]

Chordopoxvirinae

  • Avipoxvirus
  • Capripoxvirus
  • Centapoxvirus
  • Cervidpoxvirus
  • Crocodylidpoxvirus
  • Leporipoxvirus
  • Macropopoxvirus
  • Molluscipoxvirus
  • Mustelpoxvirus
  • Orthopoxvirus
  • Oryzopoxvirus
  • Parapoxvirus
  • Pteropopoxvirus
  • Salmonpoxvirus
  • Sciuripoxvirus
  • Suipoxvirus
  • vespertilionpoxvirus
  • Yatapoxvirus

Entomopoxvirinae

  • Alphaentomopoxvirus
  • Betaentomopoxvirus
  • Deltaentomopoxvirus
  • Diachasmimorpha entomopoxvirus
  • Gammaentomopoxvirus

Obe poddružini vsebujeta tudi več neklasificiranih vrst, za katere bodo v prihodnosti morda ustvarjeni novi rodovi.

  • Virus Cotia virus , odkrit leta 2012, je nenavaden predstavnik skupine Chordopoxvirinae in bi lahko pripadal novemu rodu.[11] Virus Cotia je bil leta 2019 uvrščen v nov rod Oryzopoxvirus.[12] Brazilski porcupinepox virus, odkrit leta 2019, je tesno povezan s tem virusom.[13]
  • Dva dodatna virusa iz skupine Chordopoxvirinae sta NY_014 in murmanski poksvirus. Veljata za tesno povezana z virusom "Yoka poxvirus".[14] ICTV classifies them under a genus Centapoxvirus, created 2016.[15]

Sklici

  1. ↑ http://www.termania.net/slovarji/slovenski-medicinski-slovar/5533511/poksvirus?query=poksvirus, vpogled: 3. 12. 2014.
  2. ↑ http://www.termania.net/slovarji/slovenski-medicinski-slovar/5534185/poxviridae?query=Poxviridae%20, vpogled: 3. 12. 2014.
  3. ↑ 3,0 3,1 »Virus Taxonomy: 2019 Release«. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Pridobljeno 9. maja 2020.
  4. ↑ http://www.termania.net/slovarji/mikrobioloski-slovar/7952343/poksvirus?query=poksvirus, vpogled: 3. 12. 2014.
  5. ↑ »Pathogenic Molluscum Contagiosum Virus Sequenced«. Antiviral Agents Bulletin. Biotechnology Information Institute: 196–197. 1996. Pridobljeno 16. julija 2006.
  6. ↑ »ICTVdb Descriptions: 58. Poxviridae«. International Committee on Taxonomy of Viruses. 15. junij 2004. Pridobljeno 26. februarja 2005.
  7. ↑ How Big is a ... ? at Cells Alive!. Pridobljeno 3. 12. 2014.
  8. ↑ Mutsafi, Y; Zauberman, N; Sabanay, I; Minsky, A (30. april 2010). »Vaccinia-like cytoplasmic replication of the giant Mimivirus«. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 107 (13): 5978–5982. doi:10.1073/pnas.0912737107. PMC 2851855. PMID 20231474..
  9. ↑ Racaniello, Vincent (4. april 2014). »Pithovirus: Bigger than Pandoravirus with a smaller genome«. Virology Blog. Pridobljeno 4. aprila 2014.
  10. ↑ »DNA-dependent RNA polymerase rpo35 (Vaccinia virus)«. National Center for Biotechnology Information (NCBI), NIH, Bethesda, MD, USA.
  11. ↑ Afonso PP, Silva PM, Schnellrath LC, Jesus DM, Hu J, Yang Y, Renne R, Attias M, Condit RC, Moussatché N, Damaso CR (2012) Biological characterization and next-generation genome sequencing of the unclassified Cotia virus SPAn232 (Poxviridae). J Virol
  12. ↑ »Taxonomy History [Cotia virus] - Taxonomy - ICTV«. talk.ictvonline.org.
  13. ↑ Hora, AS; Taniwaki, SA; Martins, NB; Pinto, NNR; Schlemper, AE; Santos, ALQ; Szabó, MPJ; Brandão, PE (april 2021). »Genomic Analysis of Novel Poxvirus Brazilian Porcupinepox Virus, Brazil, 2019«. Emerging Infectious Diseases. 27 (4): 1177–1180. doi:10.3201/eid2704.203818. PMC 8007330. PMID 33754985.{navedi časopis}: Vzdrževanje CS1: samodejni prevod datuma (povezava)
  14. ↑ Smithson C, Meyer H, Gigante CM, Gao J, Zhao H, Batra D, Damon I, Upton C, Li Y (2017) Two novel poxviruses with unusual genome rearrangements: NY_014 and Murmansk. Virus Genes
  15. ↑ »Taxonomy History [Yokapox virus] - Taxonomy - ICTV«. talk.ictvonline.org.