Mellan 2012 och 2017 var Valakari huvudtränare för SJK, där han förde laget till ligaseger 2015 och en cuptitel 2016. Mellan 2017 och 2020 var han huvudtränare för Tromsø Idrettslag i Norge.[2] I november 2020 blev Valakari klar som ny huvuudtränare i KuPS.[3] Sedan flyttade han till Lettland där han tränade både Auda och Riga. I oktober 2024 tog han över skotska St. Johnstone.