* Antal matcher och mål i seniorlag räknas endast för de inhemska ligorna och är korrekt per den 10 mars 2017. ** Antal landskamper och mål är korrekta per den 10 mars 2017.
Pedersen började spela fotboll som femåring i den lokala klubben BMI (Beder-Malling Idrætsforening).[1] Som 14-åring gick hon över till IK Skovbakkens juniorlag.[1] I april 2010 skrev Pedersen på sitt första A-lagskontrakt i IK Skovbakken.[2] Hon hade dock redan spelat i A-laget under förra säsongen.[2] Mellan 2012 och 2015 spelade Pedersen för Fortuna Hjørring.[3] Hon var även lagkapten i klubben.[4]
Den 8 december 2011 debuterade Pedersen för Danmarks landslag i en 4–0-vinst över Chile, en match där hon även gjorde sitt första mål.[7] Pedersen var uttagen i Danmarks trupp till Europamästerskapet 2013.[8]