Зета-варіант SARS-CoV-2

Зета-варіант SARS-CoV-2
Офіційна назва англ. Zeta (31 травня 2021)[1] Редагувати інформацію у Вікіданих
Названо на честь дзета Редагувати інформацію у Вікіданих
Дата відкриття (винаходу) квітень 2020[1] Редагувати інформацію у Вікіданих
Місце відкриття Бразилія[1] Редагувати інформацію у Вікіданих
CMNS: Зета-варіант SARS-CoV-2 у Вікісховищі Редагувати інформацію у Вікіданих

Зета-варіант, також відомий як лінія P.2,[a], є варіантом SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Вперше він був виявлений в штаті Ріо-де-Жанейро; він містить мутацію E484K, але не мутації N501Y та K417T. Він розвивався незалежно в Ріо-де-Жанейро, не будучи безпосередньо пов'язаним з варіантом Гамма з Манауса.[2] [3]

Відповідно до спрощеної схеми найменування, запропонованої Всесвітньою організацією охорони здоров’я, P.2 був позначений як «Зета-варіант» і вважався варіантом, що викликає інтерес (VOI), але не варіантом, що викликає занепокоєння.[4] Другій хвилі в листопаді 2020 року передувало збільшення поширеності варіанту Zeta серед генетичних послідовностей зі штату Сан-Паулу, занесених до бази даних GISAID.[5] Станом на липень 2021 року ВООЗ більше не розглядає Zeta як цікавий варіант.[6]

Мутації

У геномі зета-варіанта є 3 амінокислотні мутації: E484K, D614G і V1176F, всі з яких знаходяться в коді білка спайка вірусу.[7] За даними Центрів з контролю та профілактики захворювань, F565L був виявлений в деяких послідовностях варіантів Zeta, але не у всіх.[8]

  • Amino acid mutations of SARS-CoV-2 Zeta variant plotted on a genome map of SARS-CoV-2 with a focus on the spike.[7]
    Amino acid mutations of SARS-CoV-2 Zeta variant plotted on a genome map of SARS-CoV-2 with a focus on the spike.[7]

Див. також

Примітки

  1. ↑ A sub-lineage of B.1.1.28

Посилання

  1. ↑ а б в https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
  2. ↑ PANGO lineages Lineage P.2. COV lineages. Архів оригіналу за 28 квітня 2021. Процитовано 28 січня 2021. P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage
  3. ↑ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana; da Costa, Raissa Mirella (26 квітня 2021). Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil. Journal of Virology. 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194.
  4. ↑ Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological (англ.). 12 січня 2021. Архів оригіналу за 20 травня 2021. Процитовано 26 червня 2021.
  5. ↑ Ranzani, Otavio (2021). Effectiveness of the CoronaVac vaccine in the elderly population during a Gamma variant-associated epidemic of COVID-19 in Brazil (PDF). medRxiv. doi:10.1101/2021.05.19.21257472. Архів оригіналу (PDF) за 4 листопада 2021. Процитовано 5 лютого 2022.
  6. ↑ Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int (англ.). World Health Organization. Архів оригіналу за 18 червня 2021. Процитовано 5 лютого 2022.
  7. ↑ а б Spike Variants: Zeta variant, aka P.2. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. 1 липня 2021. Архів оригіналу за 30 червня 2021. Процитовано 5 липня 2021.
  8. ↑ SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 11 лютого 2020. Архів оригіналу за 16 червня 2021. Процитовано 5 липня 2021.