Футбольний клуб «Морейренсе» було засновано в 1938 році. В сезоні 1994-95 команда вперше здбула право виступати в другому дивізіоні Португалії. Шість років потому клубу вдалося транзиом четез Сегунда-Лігу потрапити до вищого дивізіону. Цього успіху команда досягла під керівництвом Мануеля Мачадо і провела в еліті два сезони поспіль. З 2002 по 2004 роки «Морейренсе» провів два відносно вдалих сезони в Прімейра-Лізі, закінчуючи змагання в середині турнірної таблиці. В сезоні 2003-04 команда показала свій найкращий результат, зайнявши 9-те місце[1]. Після цього Мануель Мачадо перейшов до більш титулованої «Віторії» (Гімарайш), а «Морейренсе» за два сезони скотився до Національного чемпіонату. В Сегунда-Лігу команді вдалося повернутися в 2010 році, а в Прімейру в 2012-му[2].