Заснований 28 вересня 1893 року. «Порту» входить до «Великої трійки Португалії» (порт.Os Três Grandes) разом з лісабонськими«Бенфікою» та «Спортінгом», які брали участь у кожному сезоні Прімейра-Ліги від моменту її заснування у 1934 році. Команда отримала прізвисько Dragões (дракони) за міфічну істоту на верхівці клубної емблеми та Azuis e brancos (синьо-білі) за кольори футболок. Вболівальників клубу називають portistas. З 2003 року «Порту» проводить свої домашні матчі на Ештадіу ду Драгау, який замінив попередній 51-річний стадіон Даш-Анташ.
«Порту» є другою найбільш титулованою командою у Португалії, маючи в активі 84 трофеї. На національному рівні команда здобула 30 титулів Чемпіонату Португалії (п'ять з яких здобуті поспіль між сезонами 1994—95 і 1998—99 та є рекордом португальського футболу), 19 Кубків Португалії, 4 титули Національного чемпіонату, 1 Кубок португальської ліги та рекордні 23 Суперкубки Португалії. «Порту» є однією з двох команд, які виграли чемпіонат Португалії без поразок у сезонах 2010—11 та 2012—13 років. Також у сезоні 2010—11 «Порту» досяг найбільшої різниці очок між першим і другим місцями за системою «три очки за перемогу» (21 очко).
28 вересня 1893 комерсант Антоніу Ніколау д'Алмейда, що експортує портвейн в Англію, оголосив про створення футбольного клубу Foot-ball Club do Porto. День заснування був обраний не випадково, 28 вересня - день народження правлячого тоді короля Португалії Карлуша I і його дружини Амелії, що народилися в один день. Антоніу д'Алмейда був переконаним монархістом.Також офіційними клубними кольорами стали кольори Королівського дому Португалії - білий і синій. На перший же матч команди були запрошені король з дружиною.Однак дружина самого д'Альмейда англійка Хільда Рамсей ненавиділа футбол і наполягла, щоб чоловік залишив свою нову забаву і зосередився на винному бізнесі. Після цього клуб фактично припинив своє існування до серпня 1906 року.
Перший трофей «Порту» виграв в 1912 році - Кубок імені Жозе Монтейру да Кошти, а перебравшись в наступному році на поле Campo da Constituição, перемагав в більшості регіональних чемпіонатах.
Роки з 1941 по 1977 у португальському футболі відзначені повною перевагою лісабонських клубів. «Бенфіка» і «Спортінг» розігрували національний титул між собою і лише двічі, в 1956 і 1959 роках дозволили Порту зайняти перше місце в чемпіонаті.
У 2003 році «Порту» під керівництвом Жозе Моурінью виграв Кубок УЄФА, Суперлігу Португалії, Кубок і Суперкубок країни. У наступному році клуб переміг і в Лізі чемпіонів (у фіналі перемогли «Монако» 3:0). Після переходу Моурінью у 2004-му «Порту» продовжив домінування на внутрішній арені, здобувши перемоги в чемпіонатах 2006, 2007, 2008, 2009.