Авіакомпанія була створена та розпочала свою діяльність у 2004 році, щоб взяти на себе поштові послуги, які раніше надавалися Falcon Air. Вона повністю належить Salenia (шведська інвестиційна компанія) і має близько 50 співробітників.[1] 1 липня 2018 року авіакомпанія Amapola Flyg розпочала пасажирські авіасполучення на регіональних маршрутах у Швеції. Amapola Flyg співпрацює зі шведською авіакомпанією Svenska Direktflyg під час бронювання, через веб-сайт якої можна забронювати рейси.[2]
Після краху ірландської Stobart Air авіакомпанія обслуговувала рейси PSO (зобов'язання щодо державних послуг) з Дубліна до Донегалу з липня 2021 року по лютий 2022 року.[3][4]