DEFA6

DEFA6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZMQ, 3QTE
Ідентифікатори
Символи	DEFA6, DEF6, HD-6, defensin alpha 6
Зовнішні ІД	OMIM: 600471 MGI: 3711900 HomoloGene: 130499 GeneCards: DEFA6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• Golgi lumen; • extracellular region; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• defense response; • defense response to bacterium; • defense response to fungus; • antimicrobial humoral response; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • killing of cells of other organism; • innate immune response in mucosa; • antibacterial humoral response; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • membrane disruption in other organism; • cellular response to lipopolysaccharide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1671
	100041688
	ENSG00000164822; ENSG00000285136
	ENSMUSG00000061845
	Q01524
	E9QLQ1
	NM_001926
	NM_001177481
	NP_001917
	NP_001170952
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DEFA6 (англ. Defensin alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 100 амінокислот, а молекулярна маса — 10 975^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRTLTILTAV	LLVALQAKAE	PLQAEDDPLQ	AKAYEADAQE	QRGANDQDFA
VSFAEDASSS	LRALGSTRAF	TCHCRRSCYS	TEYSYGTCTV	MGINHRFCCL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Секретований назовні.

Література

Jones D.E., Bevins C.L. (1993). Defensin-6 mRNA in human Paneth cells: implications for antimicrobial peptides in host defense of the human bowel. FEBS Lett. 315: 187—192. PMID 8417977 DOI:10.1016/0014-5793(93)81160-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 DOI:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2765 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q01524 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2765 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q01524 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]