MRE11

MRE11
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3T1I
Ідентифікатори
Символи	MRE11, ATLD, HNGS1, MRE11B, MRE11A, MRE11 homolog A, double strand break repair nuclease, MRE11 homolog, double strand break repair nuclease
Зовнішні ІД	OMIM: 600814 MGI: 1100512 HomoloGene: 4083 GeneCards: MRE11
Пов'язані генетичні захворювання
	ataxia-telangiectasia-like disorder
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • manganese ion binding; • GO:0004003 DNA helicase activity; • single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • 3'-5' exonuclease activity; • nuclease activity; • endonuclease activity; • double-stranded DNA binding; • endodeoxyribonuclease activity; • exonuclease activity; • hydrolase activity; • cadherin binding; • identical protein binding; • 3'-5'-exodeoxyribonuclease activity; • 5'-3' exonuclease activity;
Клітинна компонента	• site of double-strand break; • гіалоплазма; • PML body; • клітинне ядро; • цитоплазма; • нуклеоплазма; • теломера; • хромосома; • Mre11 complex; • replication fork;
Біологічний процес	• reciprocal meiotic recombination; • DNA recombination; • telomere maintenance via telomerase; • positive regulation of kinase activity; • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling; • telomeric 3' overhang formation; • negative regulation of apoptotic process; • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization; • sister chromatid cohesion; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of telomere maintenance; • DNA duplex unwinding; • homologous chromosome pairing at meiosis; • negative regulation of DNA endoreduplication; • double-strand break repair; • GO:0007126 мейоз; • double-strand break repair via homologous recombination; • positive regulation of protein autophosphorylation; • проліферація; • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling; • GO:0022415 viral process; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • positive regulation of type I interferon production; • regulation of mitotic recombination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • DNA double-strand break processing; • strand displacement; • реплікація ДНК; • DNA synthesis involved in DNA repair; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • telomere maintenance; • meiotic DNA double-strand break formation; • mitochondrial double-strand break repair via homologous recombination; • DNA strand resection involved in replication fork processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4361
	17535
	ENSG00000020922
	ENSMUSG00000031928
	P49959
	Q61216
	NM_005590; NM_005591; NM_001330347
	NM_018736; NM_001310728
	NP_001317276; NP_005581; NP_005582
	NP_001297657; NP_061206
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MRE11 (англ. MRE11 homolog, double strand break repair nuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 80 593^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTADALDDE	NTFKILVATD	IHLGFMEKDA	VRGNDTFVTL	DEILRLAQEN
EVDFILLGGD	LFHENKPSRK	TLHTCLELLR	KYCMGDRPVQ	FEILSDQSVN
FGFSKFPWVN	YQDGNLNISI	PVFSIHGNHD	DPTGADALCA	LDILSCAGFV
NHFGRSMSVE	KIDISPVLLQ	KGSTKIALYG	LGSIPDERLY	RMFVNKKVTM
LRPKEDENSW	FNLFVIHQNR	SKHGSTNFIP	EQFLDDFIDL	VIWGHEHECK
IAPTKNEQQL	FYISQPGSSV	VTSLSPGEAV	KKHVGLLRIK	GRKMNMHKIP
LHTVRQFFME	DIVLANHPDI	FNPDNPKVTQ	AIQSFCLEKI	EEMLENAERE
RLGNSHQPEK	PLVRLRVDYS	GGFEPFSVLR	FSQKFVDRVA	NPKDIIHFFR
HREQKEKTGE	EINFGKLITK	PSEGTTLRVE	DLVKQYFQTA	EKNVQLSLLT
ERGMGEAVQE	FVDKEEKDAI	EELVKYQLEK	TQRFLKERHI	DALEDKIDEE
VRRFRETRQK	NTNEEDDEVR	EAMTRARALR	SQSEESASAF	SADDLMSIDL
AEQMANDSDD	SISAATNKGR	GRGRGRRGGR	GQNSASRGGS	QRGRADTGLE
TSTRSRNSKT	AVSASRNMSI	IDAFKSTRQQ	PSRNVTTKNY	SEVIEVDESD
VEEDIFPTTS	KTDQRWSSTS	SSKIMSQSQV	SKGVDFESSE	DDDDDPFMNT
SSLRRNRR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном марганцю. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Paull T.T., Gellert M. (1998). The 3' to 5' exonuclease activity of Mre 11 facilitates repair of DNA double-strand breaks. Mol. Cell. 1: 969—979. PMID 9651580 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80097-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Trujillo K.M., Yuan S.-S.F., Lee E.Y.-H.P., Sung P. (1998). Nuclease activities in a complex of human recombination and DNA repair factors Rad50, Mre11, and p95. J. Biol. Chem. 273: 21447—21450. PMID 9705271 DOI:10.1074/jbc.273.34.21447
Zhu X.-D., Kuester B., Mann M., Petrini J.H.J., de Lange T. (2000). Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres. Nat. Genet. 25: 347—352. PMID 10888888 DOI:10.1038/77139
Lee J.-H., Paull T.T. (2004). Direct activation of the ATM protein kinase by the Mre11/Rad50/Nbs1 complex. Science. 304: 93—96. PMID 15064416 DOI:10.1126/science.1091496
Balasubramanian N., Bai P., Buchek G., Korza G., Weller S.K. (2010). Physical interaction between the herpes simplex virus type 1 exonuclease, UL12, and the DNA double-strand break-sensing MRN complex. J. Virol. 84: 12504—12514. PMID 20943970 DOI:10.1128/JVI.01506-10