RNF43

RNF43
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4KNG
Ідентифікатори
Символи	RNF43, RNF124, URCC, ring finger protein 43, SSPCS
Зовнішні ІД	OMIM: 612482 MGI: 2442609 HomoloGene: 37742 GeneCards: RNF43
Пов'язані генетичні захворювання
	рак підшлункової залози
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0005110 frizzled binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • nuclear envelope; • endoplasmic reticulum membrane; • клітинне ядро; • ендоплазматичний ретикулум; • мембрана;
Біологічний процес	• negative regulation of Wnt signaling pathway; • Wnt signaling pathway; • Wnt receptor catabolic process; • Убіквітин-залежний протеоліз; • stem cell proliferation; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • multicellular organism development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54894
	207742
	ENSG00000108375
	ENSMUSG00000034177
	Q68DV7
	Q5NCP0
	NM_001305544; NM_001305545; NM_017763
	NM_172448; NM_001363437
	NP_001292473; NP_001292474; NP_060233
	NP_766036; NP_001350366
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF43 (англ. Ring finger protein 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 85 722^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGGHQLQLA	ALWPWLLMAT	LQAGFGRTGL	VLAAAVESER	SAEQKAIIRV
IPLKMDPTGK	LNLTLEGVFA	GVAEITPAEG	KLMQSHPLYL	CNASDDDNLE
PGFISIVKLE	SPRRAPRPCL	SLASKARMAG	ERGASAVLFD	ITEDRAAAEQ
LQQPLGLTWP	VVLIWGNDAE	KLMEFVYKNQ	KAHVRIELKE	PPAWPDYDVW
ILMTVVGTIF	VIILASVLRI	RCRPRHSRPD	PLQQRTAWAI	SQLATRRYQA
SCRQARGEWP	DSGSSCSSAP	VCAICLEEFS	EGQELRVISC	LHEFHRNCVD
PWLHQHRTCP	LCMFNITEGD	SFSQSLGPSR	SYQEPGRRLH	LIRQHPGHAH
YHLPAAYLLG	PSRSAVARPP	RPGPFLPSQE	PGMGPRHHRF	PRAAHPRAPG
EQQRLAGAQH	PYAQGWGLSH	LQSTSQHPAA	CPVPLRRARP	PDSSGSGESY
CTERSGYLAD	GPASDSSSGP	CHGSSSDSVV	NCTDISLQGV	HGSSSTFCSS
LSSDFDPLVY	CSPKGDPQRV	DMQPSVTSRP	RSLDSVVPTG	ETQVSSHVHY
HRHRHHHYKK	RFQWHGRKPG	PETGVPQSRP	PIPRTQPQPE	PPSPDQQVTR
SNSAAPSGRL	SNPQCPRALP	EPAPGPVDAS	SICPSTSSLF	NLQKSSLSAR
HPQRKRRGGP	SEPTPGSRPQ	DATVHPACQI	FPHYTPSVAY	PWSPEAHPLI
CGPPGLDKRL	LPETPGPCYS	NSQPVWLCLT	PRQPLEPHPP	GEGPSEWSSD
TAEGRPCPYP	HCQVLSAQPG	SEEELEELCE	QAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Sugiura T., Yamaguchi A., Miyamoto K. (2008). A cancer-associated RING finger protein, RNF43, is a ubiquitin ligase that interacts with a nuclear protein, HAP95. Exp. Cell Res. 314: 1519—1528. PMID 18313049 doi:10.1016/j.yexcr.2008.01.013
Miyamoto K., Sakurai H., Sugiura T. (2008). Proteomic identification of a PSF/p54nrb heterodimer as RNF43 oncoprotein-interacting proteins. Proteomics. 8: 2907—2910. PMID 18655028 doi:10.1002/pmic.200800083
Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 doi:10.1101/gad.219915.113