SART3

SART3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DO4, 5JJW, 5JJX, 5CTT, 5CTR, 5JPZ, 5CTQ
Ідентифікатори
Символи	SART3, DSAP1, P100, RP11-13G14, TIP110, p110, p110(nrb), squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3, squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 3, spliceosome associated factor 3, U4/U6 recycling protein
Зовнішні ІД	OMIM: 611684 MGI: 1858230 HomoloGene: 40977 GeneCards: SART3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• U6atac snRNA binding; • GO:0031493 histone binding; • U4 snRNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • ubiquitin-specific protease binding; • U6 snRNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Тільце Кахаля; • nuclear speck; • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; • нуклеоплазма; • U4/U6 snRNP; • U6atac snRNP; • U4atac/U6atac snRNP; • клітинне ядро; • ASAP complex;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • nucleosome assembly; • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • spliceosomal tri-snRNP complex assembly; • homeostasis of number of cells; • positive regulation of histone deubiquitination; • hematopoietic stem cell proliferation; • mRNA processing; • spliceosomal snRNP assembly; • GO:0000767 cell morphogenesis; • Сплайсинг РНК; • регуляція експресії генів; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9733
	53890
	ENSG00000075856
	ENSMUSG00000018974
	Q15020
	Q9JLI8
	NM_014706
	NM_016926; NM_001356621; NM_001356623
	NP_055521
	NP_058622; NP_001343550; NP_001343552
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SART3 (англ. Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 935^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATAAETSAS	EPEAESKAGP	KADGEEDEVK	AARTRRKVLS	RAVAAATYKT
MGPAWDQQEE	GVSESDGDEY	AMASSAESSP	GEYEWEYDEE	EEKNQLEIER
LEEQLSINVY	DYNCHVDLIR	LLRLEGELTK	VRMARQKMSE	IFPLTEELWL
EWLHDEISMA	QDGLDREHVY	DLFEKAVKDY	ICPNIWLEYG	QYSVGGIGQK
GGLEKVRSVF	ERALSSVGLH	MTKGLALWEA	YREFESAIVE	AARLEKVHSL
FRRQLAIPLY	DMEATFAEYE	EWSEDPIPES	VIQNYNKALQ	QLEKYKPYEE
ALLQAEAPRL	AEYQAYIDFE	MKIGDPARIQ	LIFERALVEN	CLVPDLWIRY
SQYLDRQLKV	KDLVLSVHNR	AIRNCPWTVA	LWSRYLLAME	RHGVDHQVIS
VTFEKALNAG	FIQATDYVEI	WQAYLDYLRR	RVDFKQDSSK	ELEELRAAFT
RALEYLKQEV	EERFNESGDP	SCVIMQNWAR	IEARLCNNMQ	KARELWDSIM
TRGNAKYANM	WLEYYNLERA	HGDTQHCRKA	LHRAVQCTSD	YPEHVCEVLL
TMERTEGSLE	DWDIAVQKTE	TRLARVNEQR	MKAAEKEAAL	VQQEEEKAEQ
RKRARAEKKA	LKKKKKIRGP	EKRGADEDDE	KEWGDDEEEQ	PSKRRRVENS
IPAAGETQNV	EVAAGPAGKC	AAVDVEPPSK	QKEKAASLKR	DMPKVLHDSS
KDSITVFVSN	LPYSMQEPDT	KLRPLFEACG	EVVQIRPIFS	NRGDFRGYCY
VEFKEEKSAL	QALEMDRKSV	EGRPMFVSPC	VDKSKNPDFK	VFRYSTSLEK
HKLFISGLPF	SCTKEELEEI	CKAHGTVKDL	RLVTNRAGKP	KGLAYVEYEN
ESQASQAVMK	MDGMTIKENI	IKVAISNPPQ	RKVPEKPETR	KAPGGPMLLP
QTYGARGKGR	TQLSLLPRAL	QRPSAAAPQA	ENGPAAAPAV	AAPAATEAPK
MSNADFAKLF	LRK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Liu Y., Li J., Kim B.O., Pace B.S., He J.J. (2002). HIV-1 Tat protein-mediated transactivation of the HIV-1 long terminal repeat promoter is potentiated by a novel nuclear Tat-interacting protein of 110 kDa, Tip110. J. Biol. Chem. 277: 23854—23863. PMID 11959860 DOI:10.1074/jbc.M200773200
Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bell M., Schreiner S., Damianov A., Reddy R., Bindereif A. (2002). p110, a novel human U6 snRNP protein and U4/U6 snRNP recycling factor. EMBO J. 21: 2724—2735. PMID 12032085 DOI:10.1093/emboj/21.11.2724
Stanek D., Rader S.D., Klingauf M., Neugebauer K.M. (2003). Targeting of U4/U6 small nuclear RNP assembly factor SART3/p110 to Cajal bodies. J. Cell Biol. 160: 505—516. PMID 12578909 DOI:10.1083/jcb.200210087
Damianov A., Schreiner S., Bindereif A. (2004). Recycling of the U12-type spliceosome requires p110, a component of the U6atac snRNP. Mol. Cell. Biol. 24: 1700—1708. PMID 14749385 DOI:10.1128/MCB.24.4.1700-1708.2004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16860 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15020 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16860 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15020 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]