SATB1

SATB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
Ідентифікатори
Символи	SATB1, SATB homeobox 1, DEFDA, KTZSL
Зовнішні ІД	OMIM: 602075 MGI: 105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: SATB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • double-stranded DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• PML body; • nuclear matrix; • нуклеоплазма; • Хроматин; • клітинне ядро; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• рефлекс; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • ремоделювання хроматину; • activated T cell proliferation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • transcription, DNA-templated; • epidermis development; • histone methylation; • GO:0022415 viral process; • T cell activation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6304
	20230
	ENSG00000182568
	ENSMUSG00000023927
	Q01826
	Q60611
NM_001131010; NM_001195470; NM_002971; NM_001322871; NM_001322872;
	NM_001322873; NM_001322874; NM_001322875; NM_001322876
NM_001163630; NM_001163631; NM_001163632; NM_009122; NM_001357636;
	NM_001357637; NM_001357638; NM_001357640
NP_001124482; NP_001182399; NP_001309800; NP_001309801; NP_001309802;
	NP_001309803; NP_001309804; NP_001309805; NP_002962
NP_001157102; NP_001157103; NP_001157104; NP_033148; NP_001344565;
	NP_001344566; NP_001344567; NP_001344569
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SATB1 (англ. SATB homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 763 амінокислот, а молекулярна маса — 85 957^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDHLNEATQG	KEHSEMSNNV	SDPKGPPAKI	ARLEQNGSPL	GRGRLGSTGA
KMQGVPLKHS	GHLMKTNLRK	GTMLPVFCVV	EHYENAIEYD	CKEEHAEFVL
VRKDMLFNQL	IEMALLSLGY	SHSSAAQAKG	LIQVGKWNPV	PLSYVTDAPD
ATVADMLQDV	YHVVTLKIQL	HSCPKLEDLP	PEQWSHTTVR	NALKDLLKDM
NQSSLAKECP	LSQSMISSIV	NSTYYANVSA	AKCQEFGRWY	KHFKKTKDMM
VEMDSLSELS	QQGANHVNFG	QQPVPGNTAE	QPPSPAQLSH	GSQPSVRTPL
PNLHPGLVST	PISPQLVNQQ	LVMAQLLNQQ	YAVNRLLAQQ	SLNQQYLNHP
PPVSRSMNKP	LEQQVSTNTE	VSSEIYQWVR	DELKRAGISQ	AVFARVAFNR
TQGLLSEILR	KEEDPKTASQ	SLLVNLRAMQ	NFLQLPEAER	DRIYQDERER
SLNAASAMGP	APLISTPPSR	PPQVKTATIA	TERNGKPENN	TMNINASIYD
EIQQEMKRAK	VSQALFAKVA	ATKSQGWLCE	LLRWKEDPSP	ENRTLWENLS
MIRRFLSLPQ	PERDAIYEQE	SNAVHHHGDR	PPHIIHVPAE	QIQQQQQQQQ
QQQQQQQAPP	PPQPQQQPQT	GPRLPPRQPT	VASPAESDEE	NRQKTRPRTK
ISVEALGILQ	SFIQDVGLYP	DEEAIQTLSA	QLDLPKYTII	KFFQNQRYYL
KHHGKLKDNS	GLEVDVAEYK	EEELLKDLEE	SVQDKNTNTL	FSVKLEEELS
VEGNTDINTD	LKD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dickinson L.A., Joh T., Kohwi Y., Kohwi-Shigematsu T. (1992). A tissue-specific MAR/SAR DNA-binding protein with unusual binding site recognition. Cell. 70: 631—645. PMID 1505028 DOI:10.1016/0092-8674(92)90432-C
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dickinson L.A., Dickinson C.D., Kohwi-Shigematsu T. (1997). An atypical homeodomain in SATB1 promotes specific recognition of the key structural element in a matrix attachment region. J. Biol. Chem. 272: 11463—11470. PMID 9111059 DOI:10.1074/jbc.272.17.11463
de Belle I., Cai S., Kohwi-Shigematsu T. (1998). The genomic sequences bound to special AT-rich sequence-binding protein 1 (SATB1) in vivo in Jurkat T cells are tightly associated with the nuclear matrix at the bases of the chromatin loops. J. Cell Biol. 141: 335—348. PMID 9548713 DOI:10.1083/jcb.141.2.335
Case S.S., Huber P., Lloyd J.A. (1999). The gammaPE complex contains both SATB1 and HOXB2 and has positive and negative roles in human gamma-globin gene regulation. DNA Cell Biol. 18: 805—817. PMID 10595394 DOI:10.1089/104454999314809
Gotzmann J., Meissner M., Gerner C. (2000). The fate of the nuclear matrix-associated-region-binding protein SATB1 during apoptosis. Cell Death Differ. 7: 425—438. PMID 10800076 DOI:10.1038/sj.cdd.4400668

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10541 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017. {cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q01826 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10541 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017. {cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q01826 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]