SNX5

SNX5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SYS
Ідентифікатори
Символи	SNX5, sorting nexin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605937 MGI: 1916428 HomoloGene: 40944 GeneCards: SNX5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• dynactin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphatidylinositol binding; • protein heterodimerization activity; • lipid binding; • cadherin binding; • phosphatidylinositol-5-phosphate binding; • D1 dopamine receptor binding; • phosphatidylinositol-4-phosphate binding; • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • cell projection; • early endosome membrane; • retromer, tubulation complex; • мембрана; • ruffle; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • extrinsic component of endosome membrane; • tubular endosome; • retromer complex; • early endosome; • phagocytic cup; • cytoplasmic vesicle membrane; • macropinocytic cup; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • гіалоплазма; • brush border; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• ендоцитоз; • vesicle organization; • retrograde transport, endosome to Golgi; • protein transport; • Піноцитоз; • intracellular protein transport; • regulation of macroautophagy; • epidermal growth factor catabolic process; • positive regulation of renal sodium excretion; • negative regulation of blood pressure;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	27131
	69178
	ENSG00000089006
	ENSMUSG00000027423
	Q9Y5X3; Q5QPE4
	Q9D8U8
	NM_152227; NM_001282454; NM_014426
	NM_001199188; NM_024225
	NP_001269383; NP_055241; NP_689413
	NP_001186117; NP_077187
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNX5 (англ. Sorting nexin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 46 816^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVPELLQQ	QEEDRSKLRS	VSVDLNVDPS	LQIDIPDALS	ERDKVKFTVH
TKTTLPTFQS	PEFSVTRQHE	DFVWLHDTLI	ETTDYAGLII	PPAPTKPDFD
GPREKMQKLG	EGEGSMTKEE	FAKMKQELEA	EYLAVFKKTV	SSHEVFLQRL
SSHPVLSKDR	NFHVFLEYDQ	DLSVRRKNTK	EMFGGFFKSV	VKSADEVLFT
GVKEVDDFFE	QEKNFLINYY	NRIKDSCVKA	DKMTRSHKNV	ADDYIHTAAC
LHSLALEEPT	VIKKYLLKVA	ELFEKLRKVE	GRVSSDEDLK	LTELLRYYML
NIEAAKDLLY	RRTKALIDYE	NSNKALDKAR	LKSKDVKLAE	AHQQECCQKF
EQLSESAKEE	LINFKRKRVA	AFRKNLIEMS	ELEIKHARNN	VSLLQSCIDL
FKNN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lim J.P., Wang J.T., Kerr M.C., Teasdale R.D., Gleeson P.A. (2008). A role for SNX5 in the regulation of macropinocytosis. BMC Cell Biol. 9: 58—58. PMID 18854019 DOI:10.1186/1471-2121-9-58
Sun Y., Hedman A.C., Tan X., Schill N.J., Anderson R.A. (2013). Endosomal type Igamma PIP 5-kinase controls EGF receptor lysosomal sorting. Dev. Cell. 25: 144—155. PMID 23602387 DOI:10.1016/j.devcel.2013.03.010
Schill N.J., Hedman A.C., Choi S., Anderson R.A. (2014). Isoform 5 of PIPKIgamma regulates the endosomal trafficking and degradation of E-cadherin. J. Cell Sci. 127: 2189—2203. PMID 24610942 DOI:10.1242/jcs.132423

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14969 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-05 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9Y5X3 (англ.) . Архів оригіналу за 14 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14969 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-05 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9Y5X3 (англ.) . Архів оригіналу за 14 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]