SSX2IP

SSX2IP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG
Ідентифікатори
Символи	SSX2IP, ADIP, synovial sarcoma, X breakpoint 2 interacting protein, SSX family member 2 interacting protein, hMsd1
Зовнішні ІД	OMIM: 608690 MGI: 2139150 HomoloGene: 8522 GeneCards: SSX2IP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein domain specific binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • центр організації мікротрубочок; • Адгезивні контакти; • міжклітинні контакти; • cell projection; • цитоскелет; • cell leading edge; • клітинне ядро; • ciliary basal body; • centriolar satellite; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of cell motility; • intraciliary transport involved in cilium assembly; • regulation of Rac protein signal transduction; • адгезія клітин; • cell projection organization; • cilium assembly; • centrosome cycle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	117178
	99167
	ENSG00000117155
	ENSMUSG00000036825
	Q9Y2D8
	Q8VC66
	NM_001166293; NM_001166294; NM_001166295; NM_001166417; NM_014021
	NM_001253768; NM_001253769; NM_001253770; NM_138744; NM_001355661
	NP_001159765; NP_001159766; NP_001159767; NP_001159889; NP_054740
	NP_001240697; NP_001240698; NP_001240699; NP_620083; NP_001342590
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SSX2IP (англ. SSX family member 2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 614 амінокислот, а молекулярна маса — 71 236^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDWMTVTDP	GLSSESKTIS	QYTSETKMSP	SSLYSQQVLC	SSIPLSKNVH
SFFSAFCTED	NIEQSISYLD	QELTTFGFPS	LYEESKGKET	KRELNIVAVL
NCMNELLVLQ	RKNLLAQENV	ETQNLKLGSD	MDHLQSCYSK	LKEQLETSRR
EMIGLQERDR	QLQCKNRNLH	QLLKNEKDEV	QKLQNIIASR	ATQYNHDMKR
KEREYNKLKE	RLHQLVMNKK	DKKIAMDILN	YVGRADGKRG	SWRTGKTEAR
NEDEMYKILL	NDYEYRQKQI	LMENAELKKV	LQQMKKEMIS	LLSPQKKKPR
ERVDDSTGTV	ISDVEEDAGE	LSRESMWDLS	CETVREQLTN	SIRKQWRILK
SHVEKLDNQV	SKVHLEGFND	EDVISRQDHE	QETEKLELEI	QQCKEMIKTQ
QQLLQQQLAT	AYDDDTTSLL	RDCYLLEEKE	RLKEEWSLFK	EQKKNFERER
RSFTEAAIRL	GLERKAFEEE	RASWLKQQFL	NMTTFDHQNS	ENVKLFSAFS
GSSDWDNLIV	HSRQPQKKPH	SVSNGSPVCM	SKLTKSLPAS	PSTSDFCQTR
SCISEHSSIN	VLNITAEEIK	PNQVGGECTN	QKWSVASRPG	SQEGCYSGCS
LSYTNSHVEK	DDLP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, біогенез та деградація війок, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Guinn B., Greiner J., Schmitt M., Mills K.I. (2009). Elevated expression of the leukemia-associated antigen SSX2IP predicts survival in acute myeloid leukemia patients who lack detectable cytogenetic rearrangements. Blood. 113: 1203—1204. PMID 19179477 doi:10.1182/blood-2008-09-178848

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16509 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y2D8 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16509 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y2D8 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]