TAP2

TAP2
Ідентифікатори
Символи	TAP2, ABC18, ABCB3, APT2, D6S217E, PSF-2, PSF2, RING11, transporter 2, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), transporter 2, ATP binding cassette subfamily B member
Зовнішні ІД	OMIM: 170261 MGI: 98484 HomoloGene: 37323 GeneCards: TAP2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• MHC protein binding; • ATPase-coupled transmembrane transporter activity; • nucleotide binding; • ABC-type peptide transporter activity; • transporter activity; • tapasin binding; • MHC class Ib protein binding; • ABC-type peptide antigen transporter activity; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • TAP1 binding; • ATP binding; • peptide transmembrane transporter activity; • MHC class I protein binding; • TAP2 binding;
Клітинна компонента	• TAP complex; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • integral component of membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • nuclear speck; • phagocytic vesicle membrane; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; • MHC class I peptide loading complex;
Біологічний процес	• адаптивна імунна відповідь; • процес імунної системи; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib via ER pathway, TAP-dependent; • трансмембранний транспорт; • protein transport; • peptide transport; • GO:0022415 viral process; • cytosol to endoplasmic reticulum transport; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I; • peptide antigen transport; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6891
	21355
ENSG00000204267; ENSG00000206299; ENSG00000228582; ENSG00000206235; ENSG00000225967;
	ENSG00000237599; ENSG00000223481; ENSG00000232326
	ENSMUSG00000024339
	Q03519
	P36371
	NM_018833; NM_000544; NM_001290043
	NM_011530
	NP_000535; NP_001276972; NP_061313
	NP_035660
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAP2 (англ. Transporter 2, ATP binding cassette subfamily B member) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 75 664^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLPDLRPWT	SLLLVDAALL	WLLQGPLGTL	LPQGLPGLWL	EGTLRLGGLW
GLLKLRGLLG	FVGTLLLPLC	LATPLTVSLR	ALVAGASRAP	PARVASAPWS
WLLVGYGAAG	LSWSLWAVLS	PPGAQEKEQD	QVNNKVLMWR	LLKLSRPDLP
LLVAAFFFLV	LAVLGETLIP	HYSGRVIDIL	GGDFDPHAFA	SAIFFMCLFS
FGSSLSAGCR	GGCFTYTMSR	INLRIREQLF	SSLLRQDLGF	FQETKTGELN
SRLSSDTTLM	SNWLPLNANV	LLRSLVKVVG	LYGFMLSISP	RLTLLSLLHM
PFTIAAEKVY	NTRHQEVLRE	IQDAVARAGQ	VVREAVGGLQ	TVRSFGAEEH
EVCRYKEALE	QCRQLYWRRD	LERALYLLVR	RVLHLGVQML	MLSCGLQQMQ
DGELTQGSLL	SFMIYQESVG	SYVQTLVYIY	GDMLSNVGAA	EKVFSYMDRQ
PNLPSPGTLA	PTTLQGVVKF	QDVSFAYPNR	PDRPVLKGLT	FTLRPGEVTA
LVGPNGSGKS	TVAALLQNLY	QPTGGQVLLD	EKPISQYEHC	YLHSQVVSVG
QEPVLFSGSV	RNNIAYGLQS	CEDDKVMAAA	QAAHADDFIQ	EMEHGIYTDV
GEKGSQLAAG	QKQRLAIARA	LVRDPRVLIL	DEATSALDVQ	CEQALQDWNS
RGDRTVLVIA	HRLQTVQRAH	QILVLQEGKL	QKLAQL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Bahram S., Arnold D., Bresnahan M., Strominger J.L., Spies T. (1991). Two putative subunits of a peptide pump encoded in the human major histocompatibility complex class II region. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10094—10098. PMID 1946428 DOI:10.1073/pnas.88.22.10094
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cano P., Baxter-Lowe L.A. (1995). Novel human TAP2*103 allele shows further polymorphism in the ATP-binding domain. Tissue Antigens. 45: 139—142. PMID 7792761 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02431.x
Tang J., Allen S., Karita E., Musonda R., Kaslow R.A. (1998). New TAP2 polymorphisms in Africans. Tissue Antigens. 51: 556—562. PMID 9672156 DOI:10.1111/j.1399-0039.1998.tb02992.x
Hewitt E.W., Gupta S.S., Lehner P.J. (2001). The human cytomegalovirus gene product US6 inhibits ATP binding by TAP. EMBO J. 20: 387—396. PMID 11157746 DOI:10.1093/emboj/20.3.387
Colonna M., Bresnahan M., Bahram S., Strominger J.L., Spies T. (1992). Allelic variants of the human putative peptide transporter involved in antigen processing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 3932—3936. PMID 1570316 DOI:10.1073/pnas.89.9.3932

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:44 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017. {cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q03519 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:44 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017. {cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q03519 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]