USP25

USP25
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MUX
Ідентифікатори
Символи	USP25, USP21, ubiquitin specific peptidase 25
Зовнішні ІД	OMIM: 604736 MGI: 1353655 HomoloGene: 8374 GeneCards: USP25
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATPase binding; • GO:0070122 peptidase activity; • cysteine-type peptidase activity; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • ubiquitin protein ligase binding; • thiol-dependent deubiquitinase; • GO:1904454, GO:1904455, GO:0070138 ubiquitin-like protein-specific protease activity; • cysteine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• protein K63-linked deubiquitination; • protein K48-linked deubiquitination; • negative regulation of ERAD pathway; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • протеоліз; • protein deubiquitination; • regulation of protein stability;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	29761
	30940
	ENSG00000155313
	ENSMUSG00000022867
	Q9UHP3
	P57080
NM_001283041; NM_001283042; NM_013396; NM_001352560; NM_001352561;
	NM_001388299; NM_001388300; NM_001388301; NM_001388302
	NM_013918
	NP_001269970; NP_001269971; NP_037528; NP_001339489; NP_001339490
	NP_038946
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

USP25 (англ. Ubiquitin specific peptidase 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 055 амінокислот, а молекулярна маса — 122 218^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVEQNVLQQ	SAAQKHQQTF	LNQLREITGI	NDTQILQQAL	KDSNGNLELA
VAFLTAKNAK	TPQQEETTYY	QTALPGNDRY	ISVGSQADTN	VIDLTGDDKD
DLQRAIALSL	AESNRAFRET	GITDEEQAIS	RVLEASIAEN	KACLKRTPTE
VWRDSRNPYD	RKRQDKAPVG	LKNVGNTCWF	SAVIQSLFNL	LEFRRLVLNY
KPPSNAQDLP	RNQKEHRNLP	FMRELRYLFA	LLVGTKRKYV	DPSRAVEILK
DAFKSNDSQQ	QDVSEFTHKL	LDWLEDAFQM	KAEEETDEEK	PKNPMVELFY
GRFLAVGVLE	GKKFENTEMF	GQYPLQVNGF	KDLHECLEAA	MIEGEIESLH
SENSGKSGQE	HWFTELPPVL	TFELSRFEFN	QALGRPEKIH	NKLEFPQVLY
LDRYMHRNRE	ITRIKREEIK	RLKDYLTVLQ	QRLERYLSYG	SGPKRFPLVD
VLQYALEFAS	SKPVCTSPVD	DIDASSPPSG	SIPSQTLPST	TEQQGALSSE
LPSTSPSSVA	AISSRSVIHK	PFTQSRIPPD	LPMHPAPRHI	TEEELSVLES
CLHRWRTEIE	NDTRDLQESI	SRIHRTIELM	YSDKSMIQVP	YRLHAVLVHE
GQANAGHYWA	YIFDHRESRW	MKYNDIAVTK	SSWEELVRDS	FGGYRNASAY
CLMYINDKAQ	FLIQEEFNKE	TGQPLVGIET	LPPDLRDFVE	EDNQRFEKEL
EEWDAQLAQK	ALQEKLLASQ	KLRESETSVT	TAQAAGDPEY	LEQPSRSDFS
KHLKEETIQI	ITKASHEHED	KSPETVLQSA	IKLEYARLVK	LAQEDTPPET
DYRLHHVVVY	FIQNQAPKKI	IEKTLLEQFG	DRNLSFDERC	HNIMKVAQAK
LEMIKPEEVN	LEEYEEWHQD	YRKFRETTMY	LIIGLENFQR	ESYIDSLLFL
ICAYQNNKEL	LSKGLYRGHD	EELISHYRRE	CLLKLNEQAA	ELFESGEDRE
VNNGLIIMNE	FIVPFLPLLL	VDEMEEKDIL	AVEDMRNRWC	SYLGQEMEPH
LQEKLTDFLP	KLLDCSMEIK	SFHEPPKLPS	YSTHELCERF	ARIMLSLSRT
PADGR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bosch-Comas A., Lindsten K., Gonzalez-Duarte R., Masucci M.G., Marfany G. (2006). The ubiquitin-specific protease USP25 interacts with three sarcomeric proteins. Cell. Mol. Life Sci. 63: 723—734. PMID 16501887 DOI:10.1007/s00018-005-5533-1
Meulmeester E., Kunze M., Hsiao H.H., Urlaub H., Melchior F. (2008). Mechanism and consequences for paralog-specific sumoylation of ubiquitin-specific protease 25. Mol. Cell. 30: 610—619. PMID 18538659 DOI:10.1016/j.molcel.2008.03.021
Denuc A., Bosch-Comas A., Gonzalez-Duarte R., Marfany G. (2009). The UBA-UIM domains of the USP25 regulate the enzyme ubiquitination state and modulate substrate recognition. PLoS ONE. 4: E5571—E5571. PMID 19440361 DOI:10.1371/journal.pone.0005571
Cholay M., Reverdy C., Benarous R., Colland F., Daviet L. (2010). Functional interaction between the ubiquitin-specific protease 25 and the SYK tyrosine kinase. Exp. Cell Res. 316: 667—675. PMID 19909739 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.023

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12624 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UHP3 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12624 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UHP3 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2018. Процитовано 21 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]