VPS36

VPS36
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2HTH, 2ZME, 3CUQ
Ідентифікатори
Символи	VPS36, C13orf9, EAP45, CGI-145, vacuolar protein sorting 36 homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 610903 MGI: 1917410 HomoloGene: 9374 GeneCards: VPS36
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol-3-phosphate binding; • protein C-terminus binding; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • lipid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • late endosome; • мембрана; • late endosome membrane; • лізосома; • екзосома; • клітинне ядро; • ендосома; • ESCRT II complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • multivesicular body assembly; • transcription, DNA-templated; • endosomal transport; • protein transport; • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • macroautophagy; • GO:0015915 транспорт; • endosome transport via multivesicular body sorting pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51028
	70160
	ENSG00000136100
	ENSMUSG00000031479
	Q86VN1
	Q91XD6
	NM_016075; NM_001282168; NM_001282169
	NM_027338; NM_001368379
	NP_001269097; NP_001269098; NP_057159
	NP_081614; NP_001355308
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VPS36 (англ. Vacuolar protein sorting 36 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 43 817^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDRFVWTSGL	LEINETLVIQ	QRGVRIYDGE	EKIKFDAGTL	LLSTHRLIWR
DQKNHECCMA	ILLSQIVFIE	EQAAGIGKSA	KIVVHLHPAP	PNKEPGPFQS
SKNSYIKLSF	KEHGQIEFYR	RLSEEMTQRR	WENMPVSQSL	QTNRGPQPGR
IRAVGIVGIE	RKLEEKRKET	DKNISEAFED	LSKLMIKAKE	MVELSKSIAN
KIKDKQGDIT	EDETIRFKSY	LLSMGIANPV	TRETYGSGTQ	YHMQLAKQLA
GILQVPLEER	GGIMSLTEVY	CLVNRARGME	LLSPEDLVNA	CKMLEALKLP
LRLRVFDSGV	MVIELQSHKE	EEMVASALET	VSEKGSLTSE	EFAKLVGMSV
LLAKERLLLA	EKMGHLCRDD	SVEGLRFYPN	LFMTQS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 doi:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 doi:10.1073/pnas.2133846100
Wang T., Hong W. (2006). RILP interacts with VPS22 and VPS36 of ESCRT-II and regulates their membrane recruitment. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 413—423. PMID 17010938 doi:10.1016/j.bbrc.2006.09.064
Maleroed L., Stuffers S., Brech A., Stenmark H. (2007). Vps22/EAP30 in ESCRT-II mediates endosomal sorting of growth factor and chemokine receptors destined for lysosomal degradation. Traffic. 8: 1617—1629. PMID 17714434 doi:10.1111/j.1600-0854.2007.00630.x
Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 doi:10.1016/j.devcel.2008.04.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20312 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q86VN1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20312 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q86VN1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]