Giải vô địch bóng đá U-16 châu Á 1988 là phiên bản thứ ba của Giải vô địch bóng đá U-16 châu Á, được tổ chức bởi AFC. Giải đấu có sự tham dự của các đội tuyển U-16 của châu Á và cũng là vòng loại cho Giải vô địch bóng đá U-16 thế giới 1989 diễn ra tại Scotland. Ả Rập Xê Út vô địch giải đấu sau khi đánh bại Bahrain 2-0 ở trận chung kết, hai đội tham dự Giải vô địch bóng đá U-16 thế giới 1989, cùng với đội hạng ba Trung Quốc.