RNA複製酶
HCV NS5B RdRP stalled 4WTG
RNA複製酶 (RNA replicase)或名RNA依賴性RNA聚合酶 (RNA-dependent RNA polymerase),縮寫 RdRp 或 RDR,係一類能以RNA爲模板複製RNA的酶 。值得注意的是,這類酶與以DNA爲模板合成RNA的RNA聚合酶 (在轉錄 中扮演重要角色的酶)不是同一類酶。
RNA複製酶對於那些反義 RNA病毒 (例如流感病毒 )的增殖來說,是一種至關重要的蛋白質 [2] [3] 。RNA複製酶能合成一條RNA單鏈的互補鏈[4] [5] 。
歷史
病毒 RdRps 是在 1960 年代早期通過對腦膜炎病毒和脊髓灰質炎病毒 的研究發現的,當時觀察到這些病毒對放線菌素 不敏感,放線菌素 是一種抑制細胞 DNA 指導的 RNA 合成的藥物。 這種缺乏敏感性表明有一種病毒特異性酶可以從RNA模板而不是從DNA模板複製RNA。
分布
RdRps在整個病毒中高度保守,甚至與端粒酶有關,儘管截至2009年這是一個持續存在的問題[6] 。這種相似性導致推測病毒 RdRps 是人類端粒酶的祖先。
RdRp 最著名的例子是脊髓灰質炎病毒 。
結構
所有的RNA複製酶和不少RNA聚合酶都有一個摺疊結構。這個摺疊結構與三個亞結構域相連。上面三個結構域的形狀和人的右手想像,因而分別被稱爲「四指」(fingers)、「手掌」(palm)、「拇指」(thumb)[7] 。其中,只有手掌亞結構域有一個由四條反向平行的多肽鏈 構成的β-折疊 結構和兩個α-螺旋 結構,在各類RNA複製酶中高度保守。其中,手掌亞結構域有三個高度保守的基元(A、B,以及C)。基元A(D-x(4,5)-D)和基元C(GDD)在空間上並列。這兩個基元中的天冬氨酸殘基 與鎂離子和錳離子相連。而B基元中的天冬酰胺 殘基 則與在脫氧三磷酸核苷 中選三磷酸 核糖核苷 的過程有關,上述過程可以確保合成的是RNA而不是DNA[8] 。RNA複製酶的結構域的組織形式保守[9] ,其催化 中心也是一樣。RNA複製酶的催化中心是由一系列包含保守的氨基酸 殘基的基元 組成的,即使在同源性不高的編碼序列下也保守。
參考
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外部連結
2.7.1-2.7.4:磷酸转移酶类 /激酶 (PO4 )
2.7.1:以羟基 为受体 2.7.2 :以羧基 为受体2.7.3:以含氮基团为受体 2.7.4:以磷酸基团 为受体
磷酸甲羟戊酸
腺苷酸
核苷二磷酸
尿苷酸
鸟苷酸
硫胺素二磷酸
2.7.6 :二磷酸转移酶类 (P2 O7 )2.7.7:核苷酸基转移酶
聚合酶
磷酸解作用 由3'端至5'端的核糖核酸外切酶 尿苷酰转移酶
葡萄糖-1-磷酸尿苷酰基转移酶
半乳糖-1-磷酸尿苷酰基转移酶
鸟苷酰转移酶 其它
2.7.8:杂项
磷脂酰基转移酶类
CDP-甘油二酯—甘油-3-磷酸3-磷脂酰基转移酶
CDP-甘油二酯—丝氨酸O-磷脂酰基转移酶
CDP-甘油二酯—肌醇3-磷脂酰基转移酶
CDP-甘油二酯—胆碱O-磷脂酰基转移酶
糖基-1-磷酸转移酶类
2.7.10-2.7.13:蛋白激酶类 (PO4 ;蛋白质受体)
2.7.10:蛋白酪氨酸 2.7.11:蛋白丝氨酸/苏氨酸 2.7.12:蛋白双特异性 2.7.13:蛋白组氨酸
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