La E3 Harelbeke 2013, cinquantaseiesima edizione della corsa, valida come quinta prova del circuito UCI World Tour 2013, si svolse il 22 marzo 2013 su un percorso di 211 km. Fu vinta dallo svizzero Fabian Cancellara, al traguardo in 5h08'28" alla media di 41,04 km/h.
Furono 98 i ciclisti che portarono a termine il percorso.