Mainoo speelde in de jeugd van Cheadle & Gatley en stapte op zijn negende over naar de opleiding van Manchester United. Hier ondertekende hij in mei 2022 zijn eerste professionele contract.[1] Zijn debuut in het eerste elftal maakte de middenvelder vervolgens op 10 januari 2023, toen in de EFL Cup gespeeld werd tegen Charlton Athletic. Door een doelpunt van Antony en twee van Marcus Rashford werd met 3–0 gewonnen. Mainoo mocht van coach Erik ten Hag in de basisopstelling beginnen en hij werd na een uur spelen naar de kant gehaald ten faveure van Casemiro.[2] In februari werd zijn verbintenis opengebroken en verlengd tot medio 2027, met een optie op een jaar extra.[3] Later die maand maakte Mainoo zijn debuut in de Premier League en in november deed hij dat in de UEFA Champions League. Zijn eerste doelpunt in de hoofdmacht maakte Mainoo op 28 januari 2024, toen in de FA Cup met 2–4 van Newport County gewonnen werd.[4]