Muhadžir (Muhajir oili Mohajir) (arapski: مهاجر) je arapska riječ za izbjeglicu, useljenika ili iseljenika. Islamski kalendar Hidžra je započeo kada je Muhamed zajedno sa svojim pristašama otišao iz Meke za Medinu. Oni su se zvali Muhajiri. Korijen arapske riječi za useljenje ili iseljenje je Hijrat.
Kroz vijekove se izraz Muhajir ili Mohajiri koristio za nekoliko različitih grupa u islamskoj historiji.
Muhamed i njegove pristaše prilikom bijega iz Meke u Medinu
Muhadžiri Horezma su muslimanske izbjeglice koje su se pred najezdom Džingis Kana i njegovih Mongola u 13. vijeku sklonile u susjedne muslimanske zemlje netaknute tim događajima. Maulana Jalaluddin Rumi je tako pred mongolskim hordama pobjegao iz Afganistana i našao utočište u Anadoliji.
Krimski Muhadžiri je naziv za muslimanske izbjeglice krimskog porijella koje su se naselile u Otomanskom imperiju nakon što je Rusko Carstvo osvojilo pretežno muslimanski Krimski Kanat.
Albanski Muhadžiri je naziv koji se ponekad koristi za muslimane koji govore albanski jezik, a koji su nakon raspada Jugoslavije pronašli utočište u susjednim zemljama.
U Bosni i Hercegovini se izraz muhadžir ponekad koristi za Bošnjake koji su izbjegli pred srpskim i hrvatskim etničkim čišćenjem za vrijeme rata1990-ih godina.
Muhajir je također izraz koji se koristi za Abu Hamzu al-Muhajira, trenutnog vođu Al-Qaede u Iraku.