У дорослому футболі дебютував 2014 року виступами за команду «Алахуеленсе», взявши участь лише у 5 матчах чемпіонату.
8 червня 2016 року Варгас перейшов у «Ередіано», з якого відразу був відданий в оренду в клуб «Белень»[2]. Відіграв за команду наступний сезон, взявши участь у 34 матчах. 2 травня 2017 року, гравець офіційно приєднався до «Ередіано»[3].