CLCNKA

CLCNKA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2PFI
Ідентифікатори
Символи	CLCNKA, CLCK1, ClC-K1, hClC-Ka, chloride voltage-gated channel Ka
Зовнішні ІД	OMIM: 602024 MGI: 1930643 HomoloGene: 107317 GeneCards: CLCNKA
Пов'язані генетичні захворювання
	Bartter disease type 4b
Реагує на сполуку
	niflumic acid, DIDS
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • voltage-gated ion channel activity; • chloride channel activity; • voltage-gated chloride channel activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • chloride channel complex; • мембрана;
Біологічний процес	• ion transmembrane transport; • chloride transport; • виділення; • regulation of ion transmembrane transport; • ion transport; • трансмембранний транспорт; • chloride transmembrane transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1187
	56365
	ENSG00000186510
	ENSMUSG00000006216
	P51800
	Q9WUB6
	NM_004070; NM_001042704; NM_001257139
	NM_019701
	NP_001036169; NP_001244068; NP_004061
	NP_062675
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLCNKA (англ. Chloride voltage-gated channel Ka) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 75 285^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELVGLREG	FSGDPVTLQE	LWGPCPHIRR	AIQGGLEWLK	QKVFRLGEDW
YFLMTLGVLM	ALVSYAMNFA	IGCVVRAHQW	LYREIGDSHL	LRYLSWTVYP
VALVSFSSGF	SQSITPSSGG	SGIPELKTML	AGVILEDYLD	IKNFGAKVVG
LSCTLATGST	LFLGKVGPFV	HLSVMIAAYL	GRVRTTTIGE	PENKSKQNEM
LVAAAAVGVA	TVFAAPFSGV	LFSIEVMSSH	FSVRDYWRGF	FAATCGAFIF
RLLAVFNSEQ	ETITSLYKTS	FRVDVPFDLP	EIFFFVALGG	ICGVLSCAYL
FCQRTFLSFI	KTNRYSSKLL	ATSKPVYSAL	ATLLLASITY	PPGVGHFLAS
RLSMKQHLDS	LFDNHSWALM	TQNSSPPWPE	ELDPQHLWWE	WYHPRFTIFG
TLAFFLVMKF	WMLILATTIP	MPAGYFMPIF	ILGAAIGRLL	GEALAVAFPE
GIVTGGVTNP	IMPGGYALAG	AAAFSGAVTH	TISTALLAFE	LTGQIVHALP
VLMAVLAANA	IAQSCQPSFY	DGTIIVKKLP	YLPRILGRNI	GSHHVRVEHF
MNHSITTLAK	DTPLEEVVKV	VTSTDVTEYP	LVESTESQIL	VGIVQRAQLV
QALQAEPPSR	APGHQQCLQD	ILARGCPTEP	VTLTLFSETT	LHQAQNLFKL
LNLQSLFVTS	RGRAVGCVSW	VEMKKAISNL	TNPPAPK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у мембрані.

Література

Kieferle S., Fong P., Bens M., Vandewalle A., Jentsch T. (1994). Two highly homologous members of the ClC chloride channel family in both rat and human kidney. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6943—6947. PMID 8041726 doi:10.1073/pnas.91.15.6943
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Gradogna A., Fenollar-Ferrer C., Forrest L.R., Pusch M. (2012). Dissecting a regulatory calcium-binding site of CLC-K kidney chloride channels. J. Gen. Physiol. 140: 681—696. PMID 23148261 doi:10.1085/jgp.201210878
Markovic S., Dutzler R. (2007). The structure of the cytoplasmic domain of the chloride channel ClC-Ka reveals a conserved interaction interface. Structure. 15: 715—725. PMID 17562318 doi:10.1016/j.str.2007.04.013