Хлорний внутрішньоклітинний канал 4

Хлорний внутрішньоклітинний канал 4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2AHE, 2D2Z, 3OQS
Ідентифікатори
Символи	CLIC4, CLIC4L, H1, MTCLIC, huH1, p64H1, chloride intracellular channel 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606536 MGI: 1352754 HomoloGene: 8490 GeneCards: CLIC4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • glutathione transferase activity; • chloride channel activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • гіалоплазма; • центросома; • мембрана; • cell-cell junction; • nuclear matrix; • microtubule cytoskeleton; • клітинна мембрана; • apical part of cell; • внутрішньоклітинний; • chloride channel complex; • центр організації мікротрубочок; • Мікроворсинки; • cell surface; • міжклітинні контакти; • midbody; • мітохондрія; • actin cytoskeleton; • perinuclear region of cytoplasm; • екзосома; • цитоскелет; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• cellular response to calcium ion; • диференціація клітин; • multicellular organism growth; • regulation of ion transmembrane transport; • endothelial cell morphogenesis; • ion transport; • keratinocyte differentiation; • vacuolar acidification; • negative regulation of cell migration; • запліднення; • establishment or maintenance of apical/basal cell polarity; • chloride transport; • branching morphogenesis of an epithelial tube; • retina vasculature morphogenesis in camera-type eye; • regulation of cytoskeleton organization; • Ангіогенез; • glutathione metabolic process; • chloride transmembrane transport; • GO:0015915 транспорт; • ion transmembrane transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	25932
	29876
	ENSG00000169504
	ENSMUSG00000037242
	Q9Y696
	Q9QYB1
	NM_013943
	NM_013885
	NP_039234
	NP_038913
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Хлорний внутрішньоклітинний канал 4 (англ. Chloride intracellular channel 4) – білок, який кодується геном CLIC4, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 253 амінокислот, а молекулярна маса — 28 772^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALSMPLNGL	KEEDKEPLIE	LFVKAGSDGE	SIGNCPFSQR	LFMILWLKGV
VFSVTTVDLK	RKPADLQNLA	PGTHPPFITF	NSEVKTDVNK	IEEFLEEVLC
PPKYLKLSPK	HPESNTAGMD	IFAKFSAYIK	NSRPEANEAL	ERGLLKTLQK
LDEYLNSPLP	DEIDENSMED	IKFSTRKFLD	GNEMTLADCN	LLPKLHIVKV
VAKKYRNFDI	PKEMTGIWRY	LTNAYSRDEF	TNTCPSDKEV	EIAYSDVAKR
LTK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Berryman M., Bretscher A. (2000). Identification of a novel member of the chloride intracellular channel gene family (CLIC5) that associates with the actin cytoskeleton of placental microvilli. Mol. Biol. Cell. 11: 1509—1521. PMID 10793131 doi:10.1091/mbc.11.5.1509
Ronnov-Jessen L., Villadsen R., Edwards J.C., Petersen O.W. (2002). Differential expression of a chloride intracellular channel gene, CLIC4, in transforming growth factor-beta1-mediated conversion of fibroblasts to myofibroblasts. Am. J. Pathol. 161: 471—480. PMID 12163372 doi:10.1016/S0002-9440(10)64203-4
Berryman M.A., Goldenring J.R. (2003). CLIC4 is enriched at cell-cell junctions and colocalizes with AKAP350 at the centrosome and midbody of cultured mammalian cells. Cell Motil. Cytoskeleton. 56: 159—172. PMID 14569596 doi:10.1002/cm.10141
Tung J.J., Hobert O., Berryman M., Kitajewski J. (2009). Chloride intracellular channel 4 is involved in endothelial proliferation and morphogenesis in vitro. Angiogenesis. 12: 209—220. PMID 19247789 doi:10.1007/s10456-009-9139-3
Li Y., Li D., Zeng Z., Wang D. (2006). Trimeric structure of the wild soluble chloride intracellular ion channel CLIC4 observed in crystals. Biochem. Biophys. Res. Commun. 343: 1272—1278. PMID 16581025 doi:10.1016/j.bbrc.2006.03.099

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13518 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y696 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13518 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y696 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]