La Parigi-Bourges 2006, cinquantaseiesima edizione della corsa e valevole come prova del circuito UCI Europe Tour 2006 categoria 1.1, si svolse il 5 ottobre 2006 su un percorso di 194,3 km. Fu vinta dal francese Thomas Voeckler che giunse al traguardo con il tempo di 4h38'01", alla media di 41,933 km/h.
Presero il via 147 ciclisti, 94 di essi tagliarono il traguardo.