Ρ因子
ρ因子(ρ factor,或記作Rho factor)是指在细胞遗传学当中,是一种参与转录终止的原核蛋白。ρ因子与转录终止子暂停位点结合,后者是缺乏明显二级结构的富含C/贫含G的序列的开放阅读框后的单链RNA(一个有72个核苷酸的区段)的暴露区域[1]。
ρ因子是原核生物中必需的转录蛋白。 在大肠杆菌中,它是有相同亚基的~274.6kD的六聚体。 每个亚基具有RNA结合结构域和ATP水解结构域。 ρ是ATP依赖性六聚体螺旋酶家族的成员,其通过将核酸包裹在围绕整个六聚体延伸的单个裂口周围起作用。 ρ作为RNA聚合酶的辅助因子起作用。
于1969年在大肠杆菌中发现。分子质量为2.0×105 Da。它能识别终止信号,[2]水解各种核苷三磷酸,使得新产生的RNA从三元转录复合物中解离出来,进而停止转录。[3]
2009年大约有200个ρ终止基因座(Rho-terminated loci)通过ChIP-chip实验被验证[4]。
参考
- ^ Slonczewski, Joan, and John Watkins. Foster. Microbiology: An Evolving Science. New York: W.W. Norton &, 2009. Print.
- ^ 存档副本. [2010-08-01]. (原始内容存档于2009-08-20).
- ^ 朱玉贤等 《分子生物学》 高等教育出版社 ISBN 978-7-04-022214-2
- ^ 存档副本. [2010-08-29]. (原始内容存档于2015-07-15).
外部链接
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(1) 碱性结构域 |
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(1.1)碱性亮氨酸拉链
(bZIP) | 转录激活因子( AATF、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP( α、 β、 γ、 δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
| ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、 3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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(1.3)bHLH-ZIP | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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(1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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(1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋
(bHSH) | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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(2.1) 核受体(Cys4) | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2、 HNF4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF · 第零亚族DAX1、 SHP |
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(2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1 |
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(2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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(2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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(2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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(2.6)WRKY结构 | WRKY转录因子家族 |
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(3.1)同源异型域 | ARX · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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(3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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(3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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(3.4)热休克因子 | HSF(1、2、4) |
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(3.5)色氨酸簇 | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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(3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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(4.1) Rel homology region | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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(4.2) STAT | |
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(4.3) p53样转录因子 | |
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(4.4) MADS盒 | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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(4.6) TATA结合蛋白 | |
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(4.7) 高迁移率族 | BBX · HMGB( 1、 2、 3、 4) · HMGN、( 1、 2、 3、 4) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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(4.9) Grainyhead | TFCP2 |
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(4.10) 冷休克域 | CSDA、YBX1 |
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(4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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(0) 其他转录因子 |
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(0.2) HMGI(Y) | |
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(0.3) 袋状结构域 | |
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(0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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(0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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转录调控 | |
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启动 | |
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起始(细菌、 真核) | |
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延伸 | |
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终止(细菌、 真核) | |
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另见:转录与转录后修饰疾病
遗传学索引 |
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描述 | |
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疾病 |
- Replication and repair
- Transcription factor
- 转录相关疾病
- 轉譯相關疾病
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