P53
P53 |
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識別號 |
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别名 | TP53;, BCC7, LFS1, P53, TRP53, tumor protein p53, BMFS5, Genes, p53 |
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外部ID | OMIM:191170 MGI:98834 HomoloGene:460 GeneCards:TP53 |
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相關疾病 |
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基底細胞癌(BCC)、头颈部鳞状细胞癌、李-佛美尼症候群、Li-Fraumeni syndrome 1、B細胞慢性淋巴性白血病、liver carcinoma、急性骨髓性白血病、breast adenocarcinoma、gastric adenocarcinoma、肺腺癌、骨肉瘤、prostate adenocarcinoma、lung small cell carcinoma、肺鱗狀上皮癌、large intestine cancer、pancreatic adenocarcinoma[1] |
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RNA表达模式 |
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查阅更多表达数据 |
基因本體 |
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分子功能 | • protein N-terminus binding • DNA结合转录因子活性 • 蛋白質自締合 • core promoter sequence-specific DNA binding • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein phosphatase binding • ATP結合 • 转录因子结合 • 金屬離子結合 • protein phosphatase 2A binding • 酶结合 • 鋅離子結合 • chromatin binding • 蛋白酶結合 • damaged DNA binding • 血浆蛋白结合 • histone acetyltransferase binding • copper ion binding • protein kinase binding • chaperone binding • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • receptor tyrosine kinase binding • p53 binding • 相同蛋白质结合 • protein heterodimerization activity • 泛素蛋白连接酶结合 • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA结合 • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • TFIID-class transcription factor complex binding • mRNA 3'-UTR binding • histone deacetylase binding • 无序域特异性结合 • promoter-specific chromatin binding • histone deacetylase regulator activity • protein homodimerization activity • MDM2/MDM4 family protein binding
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細胞組分 | • 細胞質 • 線粒體 • 细胞核 • nuclear body • transcription factor TFIID complex • nuclear matrix • replication fork • 核仁 • 内质网 • 核质 • 线粒体基质 • PML body • 细胞质基质 • 胞內 • 轉錄調節複合物 • 大分子复合体 • site of double-strand break
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生物學過程 | • positive regulation of histone deacetylation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • rhythmic process • replicative senescence • negative regulation of telomerase activity • oligodendrocyte apoptotic process • cellular response to DNA damage stimulus • intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of neuron apoptotic process • regulation of mitochondrial membrane permeability • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • cellular response to ionizing radiation • positive regulation of thymocyte apoptotic process • negative regulation of helicase activity • 細胞週期 • Ras protein signal transduction • 細胞增殖 • cellular response to hypoxia • negative regulation of cell population proliferation • 核苷酸切除修复 • cellular response to glucose starvation • regulation of transcription, DNA-templated • response to antibiotic • transcription, DNA-templated • ER overload response • positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • viral process • response to gamma radiation • negative regulation of fibroblast proliferation • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • 细胞分化 • determination of adult lifespan • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • cellular response to UV • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • negative regulation of apoptotic process • protein tetramerization • oxidative stress-induced premature senescence • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria • circadian behavior • negative regulation of transcription, DNA-templated • protein localization • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • positive regulation of execution phase of apoptosis • multicellular organism development • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway • positive regulation of gene expression • mitotic G1 DNA damage checkpoint signaling • positive regulation of protein oligomerization • positive regulation of apoptotic process • entrainment of circadian clock by photoperiod • response to X-ray • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • base-excision repair • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • regulation of cell cycle G2/M phase transition • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of signal transduction by p53 class mediator • 细胞凋亡 • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein export from nucleus • 细胞程序性死亡 • regulation of apoptotic process • protein deubiquitination • phosphatidylinositol-mediated signaling • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • 自噬 • mRNA transcription • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • protein homotetramerization • protein-containing complex assembly • cellular response to gamma radiation • signal transduction by p53 class mediator • cellular response to actinomycin D • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • in utero embryonic development • somitogenesis • release of cytochrome c from mitochondria • hematopoietic progenitor cell differentiation • T cell proliferation involved in immune response • B cell lineage commitment • T cell lineage commitment • response to ischemia • double-strand break repair • regulation of transcription by RNA polymerase II • protein import into nucleus • response to oxidative stress • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • 原腸胚形成 • negative regulation of neuroblast proliferation • central nervous system development • 心脏发育 • 昼夜节律 • negative regulation of DNA replication • rRNA transcription • response to UV • response to salt stress • embryo development ending in birth or egg hatching • negative regulation of gene expression • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • cerebellum development • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • T cell differentiation in thymus • regulation of tissue remodeling • multicellular organism growth • positive regulation of mitochondrial membrane permeability • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • regulation of cell population proliferation • mitochondrial DNA repair • regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • regulation of neuron apoptotic process • negative regulation of proteolysis • negative regulation of mitotic cell cycle • bone marrow development • embryonic organ development • protein stabilization • chromosome organization • neuron apoptotic process • regulation of cell cycle • hematopoietic stem cell differentiation • interferon-gamma-mediated signaling pathway • cardiac septum morphogenesis • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • positive regulation of programmed necrotic cell death • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • regulation of thymocyte apoptotic process • 程序性坏死 • cellular response to UV-C • negative regulation of mitophagy • regulation of mitochondrial membrane permeability involved in apoptotic process • regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • negative regulation of glucose catabolic process to lactate via pyruvate • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hypoxia • regulation of fibroblast apoptotic process • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • regulation of cellular senescence
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Sources:Amigo / QuickGO |
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直系同源 |
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物種 | 人類 | 小鼠 |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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mRNA序列 | | |
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蛋白序列 | | |
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基因位置(UCSC) | Chr 17: 7.66 – 7.69 Mb | Chr 11: 69.47 – 69.48 Mb |
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PubMed查找 | [4] | [5] |
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維基數據 |
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p53是一系列被称为腫瘤抑制蛋白(也稱為p53蛋白或p53腫瘤蛋白)的同源异构蛋白的统称。由TP53(人体)及Trp53(老鼠)基因编码。该蛋白是最早发现的肿瘤抑制基因所编码的蛋白之一。p53蛋白能調節細胞週期,促使細胞出現凋亡或細胞衰老(cell senescence)等現象,从而避免细胞癌变發生。p53蛋白能保持基因組的穩定性,避免或减少突變的發生。因此被稱為基因組守護者。
p53得名于1979年,因为其的分子量於SDS凝膠電泳中測得約為53kDa。不过依據胺基酸序列进行計算后发现p53蛋白的分子量應為43.7kDa.兩者所測得之分子量差別是因为该蛋白中存在大量的脯胺酸殘基,減緩了其在SDS膠電泳中的遷移速度。而此遷移速度減緩的效應在跨物種的p53蛋白皆已被觀察,如人類,嚙齒動物,青蛙和魚類。
目前在人体内发现的p53同源异构蛋白有15种;另外由於FOXO4可和p53結合以促進細胞衰老之故[6],因此一些和FOXO4有競爭效應的胜肽,可藉由將p53屏除於細胞核之外而成為返老藥(Senolytic)。[6]
功能
p53蛋白在避免癌症發生機制上扮演重要的角色,例如,細胞凋亡 (apoptosis) 、細胞衰老(cell senescence)、基因組穩定性 (genetic stability) 、抑制血管新生 (angiogenesis)。
p53蛋白通過下列之機構達成避免癌症發生:
- 當DNA受損時,p53蛋白能活化DNA修復蛋白 (DNA repair proteins)。
- p53蛋白能抑制細胞生長,通过使细胞周期停留於G1/S的節律點上,以達成DNA損壞辨識。 (若能將細胞於此節律點上停留夠久,DNA修复蛋白將有更充裕的時間修復DNA損壞部位,並繼續細胞的生長週期。)
- 若細胞的DNA受損已不能修復,p53蛋白能起始細胞凋亡程序,避免擁有不正常遺傳資訊的細胞繼續分裂生長。
活化的p53蛋白能接合於DNA,促使多個基因表現,包括基因WAF1/CIP1,其為p21蛋白之編碼基因。 p21 (WAF1)接合於G1-S/CDK (CDK2) 和S/CDK複合體 (此蛋白在G1/S細胞週期節律點上有重要功能) 以抑制該複合體的活性。 當p21蛋白 (WAF1) 與CDK2形成複合體時,細胞將無法進入到細胞分裂的階段。 而突變後的p53蛋白將可能喪失與DNA形成有效結合的能力,造成p21蛋白將無法形成,以發出停止細胞分裂的信號。 因此,受損細胞將不受控制的進行細胞分裂,最終形成腫瘤。
根據最近的研究,p53蛋白與RB1程序經由p14ARF蛋白相互調節的可能性更加提高。
調節
p53蛋白藉由許多不同的壓力形式而激發其活性,其中包括但不僅僅侷限於DNA損傷 (包括 UV, IR或化學物質如過氧化氫 (hydrogen peroxide)所造成的損傷),氧化壓力 (oxidative stress),滲透壓力 (osmotic stress),核糖核苷酸缺乏 (nucleotide depletion) 和喪失調節癌基因表現能力。這些活性激發可由兩個主要的事件得出。首先,在受到壓力的細胞中,p53蛋白的半衰期 (half-life) 會突然的增加,造成p53蛋白在細胞中的累積。再來則是構型變化 (conformational change) 使得p53蛋白被激發成為轉錄調節因子 (transcription regulator)。
参考文献
- ^ 與P53相關的疾病;在維基數據上查看/編輯參考.
- ^ 2.0 2.1 2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000141510 - Ensembl, May 2017
- ^ 3.0 3.1 3.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059552 - Ensembl, May 2017
- ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ 6.0 6.1 Baar, Marjolein P.; Brandt, Renata M.C.; Putavet, Diana A.; Klein, Julian D.D.; Derks, Kasper W.J.; Bourgeois, Benjamin R.M.; Stryeck, Sarah; Rijksen, Yvonne; van Willigenburg, Hester; Feijtel, Danny A.; van der Pluijm, Ingrid; Essers, Jeroen; van Cappellen, Wiggert A.; van IJcken, Wilfred F.; Houtsmuller, Adriaan B.; Pothof, Joris; de Bruin, Ron W.F.; Madl, Tobias; Hoeijmakers, Jan H.J.; Campisi, Judith; de Keizer, Peter L.J. Targeted Apoptosis of Senescent Cells Restores Tissue Homeostasis in Response to Chemotoxicity and Aging. Cell. March 2017, 169 (1): 132–147.e16. PMC 5556182 . PMID 28340339. doi:10.1016/j.cell.2017.02.031.
外部链接
参见
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- Template:PDB Gallery/7157
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| (1) 碱性结构域 |
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| | 转录激活因子( AATF、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP( α、 β、 γ、 δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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| | ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、 3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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| (1.3)bHLH-ZIP | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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| (1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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| (1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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| | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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| | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2、 HNF4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF · 第零亚族DAX1、 SHP |
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| (2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1 |
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| (2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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| (2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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| (2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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| | WRKY转录因子家族 |
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| | ARX · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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| (3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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| (3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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| (3.4)热休克因子 | HSF(1、2、4) |
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| (3.5)色氨酸簇 | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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| (3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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| | (4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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| (4.1) Rel homology region | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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| (4.3) p53样转录因子 | |
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| | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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| | BBX · HMGB( 1、 2、 3、 4) · HMGN、( 1、 2、 3、 4) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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| (4.9) Grainyhead | TFCP2 |
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| (4.10) 冷休克域 | CSDA、YBX1 |
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| (4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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| | (0) 其他转录因子 |
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| (0.2) HMGI(Y) | |
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| (0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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| (0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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| 配體 | |
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| 受体 | |
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| 胞内信号P+P | | |
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| TGFβ信号通路 | |
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| 河马信号通路 | TSP:神经纤维瘤蛋白2/膜突样蛋白 |
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| MAPK/ERK途径 |
- TSP:神经纤维瘤蛋白1
- ONCO:c-Ras
- HRAS
- c-Raf
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| 其他/未知 | |
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| 核 | | |
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| |
- TSP: KLF6
- ONCO: AP-1
- c-Myc
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| 线粒体 | |
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| 其他/未分组 |
- c-Bcl-2 - Notch - 抑微管装配蛋白
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| 週期素 |
- A(A1、A2)
- B(B1、B2、B3)
- D(D1、D2、D3)
- E(E1、E2)
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| CDK |
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- z
- 9
- 10
- 周期蛋白依赖性激酶激活激酶
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| CDK抑制因子 | |
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| P53 p63 p73家族 | |
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| 其他 |
- Cdc2
- Cdc25
- Cdc42
- 细胞凋亡易感蛋白
- E2F
- 促成熟因子
- Wee
- Cullin
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| 期与 检查点 | |
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