IRF7
IRF7
Ідентифікатори
Символи
IRF7 , IRF-7H, IRF7A, IRF7B, IRF7C, IRF7H, IMD39, interferon regulatory factor 7, IRF-7
Зовнішні ІД
OMIM : 605047 MGI: 1859212 HomoloGene: 128624 GeneCards: IRF7
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • endosome membrane • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • regulation of adaptive immune response • response to virus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of type I interferon production • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of macrophage apoptotic process • type I interferon signaling pathway • immunoglobulin mediated immune response • establishment of viral latency • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • regulation of monocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of interferon-beta production • interferon-beta production • regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • interferon-alpha production • defense response to virus • регуляція експресії генів
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 0.61 – 0.62 Mb
Хр. 7: 140.84 – 140.85 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
IRF7 (англ. Interferon regulatory factor 7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот , а молекулярна маса — 54 278[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MALAPERAAP RVLFGEWLLG EISSGCYEGL QWLDEARTCF RVPWKHFARK
DLSEADARIF KAWAVARGRW PPSSRGGGPP PEAETAERAG WKTNFRCALR
STRRFVMLRD NSGDPADPHK VYALSRELCW REGPGTDQTE AEAPAAVPPP
QGGPPGPFLA HTHAGLQAPG PLPAPAGDKG DLLLQAVQQS CLADHLLTAS
WGADPVPTKA PGEGQEGLPL TGACAGGPGL PAGELYGWAV ETTPSPGPQP
AALTTGEAAA PESPHQAEPY LSPSPSACTA VQEPSPGALD VTIMYKGRTV
LQKVVGHPSC TFLYGPPDPA VRATDPQQVA FPSPAELPDQ KQLRYTEELL
RHVAPGLHLE LRGPQLWARR MGKCKVYWEV GGPPGSASPS TPACLLPRNC
DTPIFDFRVF FQELVEFRAR QRRGSPRYTI YLGFGQDLSA GRPKEKSLVL
VKLEPWLCRV HLEGTQREGV SSLDSSSLSL CLSSANSLYD DIECFLMELE
QPA
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет , вроджений імунітет , взаємодія хазяїн-вірус , транскрипція , регуляція транскрипції , противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Zhang L., Pagano J.S. (1997). IRF-7, a new interferon regulatory factor associated with Epstein-Barr virus latency . Mol. Cell. Biol . 17 : 5748—5757. PMID 9315633 DOI :10.1128/MCB.17.10.5748
Au W.-C., Moore P.A., LaFleur D.W., Tombal B., Pitha P.M. (1998). Characterization of the interferon regulatory factor-7 and its potential role in the transcription activation of interferon A genes. J. Biol. Chem . 273 : 29210—29217. PMID 9786932 DOI :10.1074/jbc.273.44.29210
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Marie I.J., Smith E., Prakash A., Levy D.E. (2000). Phosphorylation-induced dimerization of interferon regulatory factor 7 unmasks DNA binding and a bipartite transactivation domain . Mol. Cell. Biol . 20 : 8803—8814. PMID 11073981 DOI :10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000
Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein. J. Biol. Chem . 276 : 8951—8957. PMID 11124948 DOI :10.1074/jbc.M008717200
Zhang L., Pagano J.S. (2002). Structure and function of IRF-7. J. Interferon Cytokine Res . 22 : 95—101. PMID 11846980 DOI :10.1089/107999002753452700
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3
Стероїдні гормони
Естроген-зв'язувальні
підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
The article is a derivative under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License .
A link to the original article can be found here and attribution parties here
By using this site, you agree to the Terms of Use . Gpedia ® is a registered trademark of the Cyberajah Pty Ltd