Рецептор вітаміну D

VDR
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DB1, 1IE8, 1IE9, 1KB2, 1KB4, 1KB6, 1S0Z, 1S19, 1TXI, 1YNW, 2HAM, 2HAR, 2HAS, 2HB7, 2HB8, 3A2I, 3A2J, 3A3Z, 3A40, 3A78, 3AUQ, 3AUR, 3AX8, 3AZ1, 3AZ2, 3AZ3, 3B0T, 3CS4, 3CS6, 3KPZ, 3M7R, 3OGT, 3P8X, 3TKC, 3VHW, 4G2I, 3W0A, 3W0C, 3W0Y, 3WGP, 3WWR, 4ITE, 4ITF, 4PA2, 3X31, 3X36, 4FHH, 4FHI, 2HBH
Ідентифікатори
Символи	VDR, NR1I1, PPP1R163, vitamin D (1,25- dihydroxyvitamin D3) receptor, vitamin D receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 601769 MGI: 103076 HomoloGene: 37297 GeneCards: VDR
Пов'язані генетичні захворювання
	vitamin D-dependent rickets, type 2
Реагує на сполуку
	кальцитріол, calcipotriene, doxercalciferol, lithocholic acid, paricalcitol, tacalcitol
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lithocholic acid binding; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • lithocholic acid receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • vitamin D response element binding; • retinoid X receptor binding; • calcitriol binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • vitamin D binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • receptor complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • цитоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of apoptotic process involved in mammary gland involution; • positive regulation of keratinocyte differentiation; • regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity; • intestinal absorption; • calcium ion transport; • steroid hormone mediated signaling pathway; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • лактація; • bile acid signaling pathway; • animal organ morphogenesis; • GO:0000767 cell morphogenesis; • skeletal system development; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • negative regulation of keratinocyte proliferation; • decidualization; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of vitamin D 24-hydroxylase activity; • mammary gland branching involved in pregnancy; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • cellular calcium ion homeostasis; • transcription, DNA-templated; • vitamin D receptor signaling pathway; • vitamin D metabolic process; • диференціація клітин; • intracellular receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7421
	22337
	ENSG00000111424
	ENSMUSG00000022479
	P11473
	P48281
NM_000376; NM_001017535; NM_001017536; NM_001364085; NM_001374661;
	NM_001374662
	NM_009504
NP_000367; NP_001017535; NP_001017536; NP_001351014; NP_001361590;
	NP_001361591
	NP_033530
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VDR (англ. Vitamin D receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 48 289^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAMAASTSL	PDPGDFDRNV	PRICGVCGDR	ATGFHFNAMT	CEGCKGFFRR
SMKRKALFTC	PFNGDCRITK	DNRRHCQACR	LKRCVDIGMM	KEFILTDEEV
QRKREMILKR	KEEEALKDSL	RPKLSEEQQR	IIAILLDAHH	KTYDPTYSDF
CQFRPPVRVN	DGGGSHPSRP	NSRHTPSFSG	DSSSSCSDHC	ITSSDMMDSS
SFSNLDLSEE	DSDDPSVTLE	LSQLSMLPHL	ADLVSYSIQK	VIGFAKMIPG
FRDLTSEDQI	VLLKSSAIEV	IMLRSNESFT	MDDMSWTCGN	QDYKYRVSDV
TKAGHSLELI	EPLIKFQVGL	KKLNLHEEEH	VLLMAICIVS	PDRPGVQDAA
LIEAIQDRLS	NTLQTYIRCR	HPPPGSHLLY	AKMIQKLADL	RSLNEEHSKQ
YRCLSFQPEC	SMKLTPLVLE	VFGNEIS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Goto H., Chen K.S., Prahl J.M., Deluca H.F. (1992). A single receptor identical with that from intestine/T47D cells mediates the action of 1,25-dihydroxyvitamin D-3 in HL-60 cells. Biochim. Biophys. Acta. 1132: 103—108. PMID 1324736 doi:10.1016/0167-4781(92)90063-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Mahajan M.A., Samuels H.H. (2000). A new family of nuclear receptor coregulators that integrates nuclear receptor signaling through CBP. Mol. Cell. Biol. 20: 5048—5063. PMID 10866662 doi:10.1128/MCB.20.14.5048-5063.2000
Rochel N., Wurtz J.-M., Mitschler A., Klaholz B., Moras D. (2000). The crystal structure of the nuclear receptor for vitamin D bound to its natural ligand. Mol. Cell. 5: 173—179. PMID 10678179 doi:10.1016/S1097-2765(00)80413-X
Tocchini-Valentini G., Rochel N., Wurtz J.-M., Mitschler A., Moras D. (2001). Crystal structures of the vitamin D receptor complexed to superagonist 20-epi ligands. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 5491—5496. PMID 11344298 doi:10.1073/pnas.091018698
Shaffer P.L., Gewirth D.T. (2002). Structural basis of VDR-DNA interactions on direct repeat response elements. EMBO J. 21: 2242—2252. PMID 11980721 doi:10.1093/emboj/21.9.2242