SOX15 SOX15
Ідентифікатори
Символи SOX15 , SOX20, SOX26, SOX27, SRY-box 15, SRY-box transcription factor 15Зовнішні ІД OMIM : 601297 MGI: 98363 HomoloGene: 74586 GeneCards: SOX15 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес • positive regulation of myoblast proliferation • диференціація клітин • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration • negative regulation of striated muscle tissue development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of G0 to G1 transition • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • myoblast development • skeletal muscle tissue regeneration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • central nervous system development • neuron differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 17: 7.59 – 7.59 Mb Хр. 11: 69.55 – 69.55 Mb PubMed search [ 1] [ 2] Вікідані
SOX15 (англ. SRY-box 15 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислот , а молекулярна маса — 25 251[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MALPGSSQDQ AWSLEPPAAT AAASSSSGPQ EREGAGSPAA PGTLPLEKVK RPMNAFMVWS SAQRRQMAQQ NPKMHNSEIS KRLGAQWKLL DEDEKRPFVE EAKRLRARHL RDYPDYKYRP RRKAKSSGAG PSRCGQGRGN LASGGPLWGP GYATTQPSRG FGYRPPSYST AYLPGSYGSS HCKLEAPSPC SLPQSDPRLQ GELLPTYTHY LPPGSPTPYN PPLAGAPMPL THL
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Goze C., Poulat F., Berta P. (1993). Partial cloning of SOX-11 and SOX-12, two new human SOX genes. Nucleic Acids Res . 21 : 2943—2943. PMID 8332506 DOI :10.1093/nar/21.12.2943 Vujic M., Rajic T., Goodfellow P.N., Stevanovic M. (1998). cDNA characterization and high resolution mapping of the human SOX20 gene. Mamm. Genome . 9 : 1059—1061. PMID 9880678 DOI :10.1007/s003359900925 Meyer J., Wirth J., Held M., Schempp W., Scherer G. (1996). SOX20, a new member of the SOX gene family, is located on chromosome 17p13. Cytogenet. Cell Genet . 72 : 246—249. PMID 8978787
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 Стероїдні гормони[en] Естроген-зв'язувальні підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
The article is a derivative under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License .
A link to the original article can be found here and attribution parties here
By using this site, you agree to the Terms of Use . Gpedia ® is a registered trademark of the Cyberajah Pty Ltd