IRX3
IRX3
Ідентифікатори
Символи
IRX3 , IRX-1, IRXB1, iroquois homeobox 3
Зовнішні ІД
OMIM : 612985 MGI: 1197522 HomoloGene: 7385 GeneCards: IRX3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • аксон • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • mesoderm development • specification of loop of Henle identity • metanephros development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • proximal/distal pattern formation involved in nephron development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • energy homeostasis
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 54.28 – 54.29 Mb
Хр. 8: 92.53 – 92.53 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
IRX3 (англ. Iroquois homeobox 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот , а молекулярна маса — 52 119[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSFPQLGYQY IRPLYPSERP GAAGGSGGSA GARGGLGAGA SELNASGSLS
NVLSSVYGAP YAAAAAAAAA QGYGAFLPYA AELPIFPQLG AQYELKDSPG
VQHPAAAAAF PHPHPAFYPY GQYQFGDPSR PKNATRESTS TLKAWLNEHR
KNPYPTKGEK IMLAIITKMT LTQVSTWFAN ARRRLKKENK MTWAPRSRTD
EEGNAYGSER EEEDEEEDEE DGKRELELEE EELGGEEEDT GGEGLADDDE
DEEIDLENLD GAATEPELSL AGAARRDGDL GLGPISDSKN SDSEDSSEGL
EDRPLPVLSL APAPPPVAVA SPSLPSPPVS LDPCAPAPAP ASALQKPKIW
SLAETATSPD NPRRSPPGAG GSPPGAAVAP SALQLSPAAA AAAAHRLVSA
PLGKFPAWTN RPFPGPPPGP RLHPLSLLGS APPHLLGLPG AAGHPAAAAA
FARPAEPEGG TDRCSALEVE KKLLKTAFQP VPRRPQNHLD AALVLSALSS
S
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку, фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
Стероїдні гормони
Естроген-зв'язувальні
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші
The article is a derivative under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License .
A link to the original article can be found here and attribution parties here
By using this site, you agree to the Terms of Use . Gpedia ® is a registered trademark of the Cyberajah Pty Ltd