ATF6B

ATF6B
Ідентифікатори
Символи	ATF6B, CREB-RP, CREBL1, G13, activating transcription factor 6 beta
Зовнішні ІД	OMIM: 600984 MGI: 105121 HomoloGene: 31238 GeneCards: ATF6B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cAMP response element binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинний; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • protein-DNA complex; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • система ендомембран; • ядерце; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • Відповідь на незгорнуті білки; • ATF6-mediated unfolded protein response; • response to unfolded protein; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of ATF6-mediated unfolded protein response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1388
	12915
	ENSG00000213676; ENSG00000228628; ENSG00000234539; ENSG00000168468
	ENSMUSG00000015461
	Q99941
	O35451
	NM_004381; NM_001136153
	NM_017406
	NP_001129625; NP_004372
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATF6B (англ. Activating transcription factor 6 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 76 709^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAELMLLSEI	ADPTRFFTDN	LLSPEDWGLQ	NSTLYSGLDE	VAEEQTQLFR
CPEQDVPFDG	SSLDVGMDVS	PSEPPWELLP	IFPDLQVKSE	PSSPCSSSSL
SSESSRLSTE	PSSEALGVGE	VLHVKTESLA	PPLCLLGDDP	TSSFETVQIN
VIPTSDDSSD	VQTKIEPVSP	CSSVNSEASL	LSADSSSQAF	IGEEVLEVKT
ESLSPSGCLL	WDVPAPSLGA	VQISMGPSLD	GSSGKALPTR	KPPLQPKPVV
LTTVPMPSRA	VPPSTTVLLQ	SLVQPPPVSP	VVLIQGAIRV	QPEGPAPSLP
RPERKSIVPA	PMPGNSCPPE	VDAKLLKRQQ	RMIKNRESAC	QSRRKKKEYL
QGLEARLQAV	LADNQQLRRE	NAALRRRLEA	LLAENSELKL	GSGNRKVVCI
MVFLLFIAFN	FGPVSISEPP	SAPISPRMNK	GEPQPRRHLL	GFSEQEPVQG
VEPLQGSSQG	PKEPQPSPTD	QPSFSNLTAF	PGGAKELLLR	DLDQLFLSSD
CRHFNRTESL	RLADELSGWV	QRHQRGRRKI	PQRAQERQKS	QPRKKSPPVK
AVPIQPPGPP	ERDSVGQLQL	YRHPDRSQPA	FLDAIDRRED	TFYVVSFRRD
HLLLPAISHN	KTSRPKMSLV	MPAMAPNETL	SGRGAPGDYE	EMMQIECEVM
DTRVIHIKTS	TVPPSLRKQP	SPTPGNATGG	PLPVSAASQA	HQASHQPLYL
NHP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Khanna A., Campbell R.D. (1996). The gene G13 in the class III region of the human MHC encodes a potential DNA-binding protein. Biochem. J. 319: 81—89. PMID 8870652 DOI:10.1042/bj3190081
Speek M., Barry F., Miller W.L. (1996). Alternate promoters and alternate splicing of human tenascin-X, a gene with 5' and 3' ends buried in other genes. Hum. Mol. Genet. 5: 1749—1758. PMID 8923003 DOI:10.1093/hmg/5.11.1749

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2349 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99941 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2349 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q99941 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]