SATB2

SATB2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WI3, 1WIZ, 2CSF
Ідентифікатори
Символи	SATB2, GLSS, SATB homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608148 MGI: 2679336 HomoloGene: 32249 GeneCards: SATB2
Пов'язані генетичні захворювання
	неспецифічний виразковий коліт, isolated cleft palate, chromosome 2q32-q33 deletion syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• histone deacetylase complex; • transcription regulator complex; • nuclear matrix; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain; • embryonic skeletal system morphogenesis; • cellular response to organic substance; • ремоделювання хроматину; • roof of mouth development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • embryonic pattern specification; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • neuron migration; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • cartilage development; • регуляція експресії генів; • osteoblast development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23314
	212712
	ENSG00000119042
	ENSMUSG00000038331
	Q9UPW6
	Q8VI24
	NM_001172509; NM_001172517; NM_015265
	NM_139146; NM_001358580; NM_001358581
	NP_001165980; NP_001165988; NP_056080
	NP_631885; NP_001345509; NP_001345510
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SATB2 (англ. SATB homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 733 амінокислот, а молекулярна маса — 82 555^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERRSESPCL	RDSPDRRSGS	PDVKGPPPVK	VARLEQNGSP	MGARGRPNGA
VAKAVGGLMI	PVFCVVEQLD	GSLEYDNREE	HAEFVLVRKD	VLFSQLVETA
LLALGYSHSS	AAQAQGIIKL	GRWNPLPLSY	VTDAPDATVA	DMLQDVYHVV
TLKIQLQSCS	KLEDLPAEQW	NHATVRNALK	ELLKEMNQST	LAKECPLSQS
MISSIVNSTY	YANVSATKCQ	EFGRWYKKYK	KIKVERVERE	NLSDYCVLGQ
RPMHLPNMNQ	LASLGKTNEQ	SPHSQIHHST	PIRNQVPALQ	PIMSPGLLSP
QLSPQLVRQQ	IAMAHLINQQ	IAVSRLLAHQ	HPQAINQQFL	NHPPIPRAVK
PEPTNSSVEV	SPDIYQQVRD	ELKRASVSQA	VFARVAFNRT	QGLLSEILRK
EEDPRTASQS	LLVNLRAMQN	FLNLPEVERD	RIYQDERERS	MNPNVSMVSS
ASSSPSSSRT	PQAKTSTPTT	DLPIKVDGAN	INITAAIYDE	IQQEMKRAKV
SQALFAKVAA	NKSQGWLCEL	LRWKENPSPE	NRTLWENLCT	IRRFLNLPQH
ERDVIYEEES	RHHHSERMQH	VVQLPPEPVQ	VLHRQQSQPA	KESSPPREEA
PPPPPPTEDS	CAKKPRSRTK	ISLEALGILQ	SFIHDVGLYP	DQEAIHTLSA
QLDLPKHTII	KFFQNQRYHV	KHHGKLKEHL	GSAVDVAEYK	DEELLTESEE
NDSEEGSEEM	YKVEAEEENA	DKSKAAPAEI	DQR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dobreva G., Dambacher J., Grosschedl R. (2003). SUMO modification of a novel MAR-binding protein, SATB2, modulates immunoglobulin mu gene expression. Genes Dev. 17: 3048—3061. PMID 14701874 DOI:10.1101/gad.1153003
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033